添設兵馬司。至正十年十月，中書省奏：「東南千里外，妖氣見，合立兵馬司四處，掌防禦之職。」遂置大名兵馬司、東平兵馬司、濟南兵馬司、徐州兵馬司。每司置都指揮、指揮各二員，副指揮各四員，經歷、知事、提控案牘各一員，譯史各二人，司吏各十二人，奏差各八人，貼書各二十四人，忽剌罕赤各三十人，司獄各一員，獄丞各一員。十一年，罷沂州分元帥府，改立兵馬指揮使司。十五年十月，濟寧兵馬司添設副指揮二員。
各處寶泉提舉司。至正十一年十月，置寶泉提舉司于河南行省及濟南、冀寧等處，凡九所。江浙、江西、湖廣行省各一所。十二年三月，置銅冶場于饒州路德興縣、信州路鉛山州、韶州岑水，凡三處。每所置提領一員，正八品；大使一員，從八品；副使一員，正九品；流官內銓注。直隷寶泉提舉司，掌浸銅事。
湖南道宣慰使司都元帥府。至元元年六月奏準，湖南道宣慰使司兼都元帥府，總領所轄路分鎮守萬戶軍馬。
邦牙等處宣慰使司都元帥府，至元四年十二月置。先是，以緬地處雲南極邊，就立其酋長為帥，三年一貢方物。至是來貢，故改立官府以獎異之。
永昌等處宣慰使司都元帥府。至正三年七月，中書省奏：「闊端阿哈所分地方，接連西番，自脫脫木兒既沒之後，無人承嗣。達達人口頭匹，時被西番劫奪殺傷，深為未便。」遂定置永昌等處宣慰使司都元帥府以治之，置宣慰使三員、同知二員、副使二員。首領官：經歷、知事、照磨各一員，令史十人，蒙古譯史四人，知印二人，怯裡馬赤一人，奏差八人，典吏二人。
山東東西道宣慰使司都元帥府，至正六年十二月改立，掌開設屯田、屯駐軍馬之事。
荊湖北道宣慰使司都元帥府。至正十一年十一月奏準，荊湖北道宣慰使司兼都元帥府。
浙東宣慰司。至正十二年正月，添設宣慰使一員、同知一員、都事二員。
淮東等處宣慰使司都元帥府，至正十五年二月置。統率濠泗義兵萬戶府，並洪澤等處義兵。招誘富民，出丁壯五千名者為萬戶，五百名者為千戶，一百名者為百戶，降宣敕牌面與之，命置司于泗州天長縣。
興元等處宣慰使司都元帥府，至正十五年十二月置。
江州等處宣慰使司都元帥府，至正十六年九月奏準，宣慰使都元帥廷授，佐貳僚屬，命江西行省平章政事道童、火你赤承製署之。
河南宣慰司。至正十九年十月，罷洛陽招討軍民萬戶府，置宣慰司，以張俊為宣慰使。
東路都蒙古軍都元帥府，至正八年正月置。
分元帥府。至正八年十二月，以福建盜起，詔汀、漳二州立分元帥府，以討捕之。十一月，命買列的開分元帥府于沂州，以鎮禦東海群盜。十一年正月，湖南寶慶路置分元帥府，又置寶武分元帥府。三月，置山東分元帥府于登州，提調登、萊、寧海三州三十六處海口事。十二年二月，置安東、安豐二處分元帥府。
水軍元帥府。至正二十六年二月，置河淮水軍元帥府于孟津縣。
紹熙軍民宣撫司。至元四年，因監察御史言：「四川在宋時，有紹熙一府，統六州、二十縣、一百五十二鎮。近年雍、梁、淮甸人民，見彼中田疇廣闊，開墾成業者，凡二十餘萬戶。」省部議定，遂奏準置紹熙等處軍民宣撫司。正官六員，宣撫使、同知、副使各二員。首領官三員，經歷、知事、提控案牘各一員。司獄一員，蒙古、儒學教授各一員，令史八人，譯吏、知印、怯裡馬赤各一人，奏差四人。所隷資、普、昌、隆下州四處，盤石、內江、安岳、昌元、貴平下縣五處，巡檢司一十三處，各設官如制。又置都總使司，命御史大夫脫脫兼都總使，治書侍御史吉當普為副都總使。至元六年十一月，中書又因台臣言裁減冗官事，遂罷紹熙軍民宣撫司。
永順宣撫司。至正十一年四月，改升永順安撫司為宣撫司。
平緬宣撫司。至正十五年八月，以雲南死可伐等降，令其子莽三入貢方物，乃置平緬宣撫司以覊縻之。
忠孝軍民安撫司。至正十一年七月，革罷四川省所轄大奴管勾等洞長官司，立忠孝軍民府。至十五年四月，詔改為忠孝軍民安撫司。
忠義軍民安撫司。至正十五年四月，罷四川羊母甲洞、臭南王洞長官司，置忠義軍民安撫司。又罷盤順府，置盤順軍民安撫司。
宣化鎮南五路軍民府。至正十五年四月，命于四川置立提調軍民鎮撫所、蠻夷軍民千戶所。
團練安撫勸農使司。至正十八年九月，置奉元延安等處團練安撫勸農使司于耀州，鞏昌等處團練安撫勸農使司于邠州，以行省丞相朵朵、行台大夫完者帖木兒領之，各設參謀一人。每道置使二人，同知、副使各二人，檢督六人，經歷、知事、照磨各一人。
防禦使。至正十七年正月，準山東分省咨，團結義兵，每州添設州判一員，每縣添設主簿一員，詔有司正官俱兼防禦使事，聽宣慰使司節制。
屯田使司。至正十五年十二月，置軍民屯田使司于沛縣，正三品。
屯田打捕總管府。至元四年五月，升兩淮屯田打捕總管府為正三品。
黎兵萬戶府。元統二年十月，湖廣行省咨：「海南僻在極邊，南接占城，西鄰交趾，環海四千餘里，中盤百洞，黎、獠雜居，宜立萬戶府以鎮之。」中書省奏準，依廣西屯田萬戶府例，置黎兵萬戶府。萬戶三員，正三品。千戶所一十三處，正五品。每所領百戶所八處，正七品。
水軍萬戶府。至正十三年十月，置水軍都萬戶府于崑山州，以浙東宣慰使納麟哈剌為正萬戶，宣慰使董摶霄為副萬戶。十四年二月，立鎮江水軍萬戶府，命江浙行省右丞佛家閭領之。十五年十月，置水軍萬戶府于黃河小清口。
義兵萬戶府。至正十四年二月，詔河南、淮南兩省並立義兵萬戶府。五月，置南陽、鄧州等處毛胡蘆義兵萬戶府，募土人為軍，免其差役，令討賊自效。先是，鄉人自相團結，號毛胡蘆，故因以名之。十五年四月，置汴梁等處義兵萬戶府。十二月，置忠義、忠勤萬戶府于宿州及武安州。
招討軍民萬戶府。至正二十年，以鞏縣為招討軍民萬戶府。二十六年三月，置嵩州軍民招討萬戶府。
義兵千戶所。至正十年七月中書奏準，于廣西平樂等古城竹山院、桑江隘、尊化鄉、剌場嶺，湖南道州路、武岡路、湖北靖州路等處，置義兵千戶所，每所置千戶一員、彈壓一員、百戶十員。仍于義兵內推選才勇功能，充千戶、彈壓、百戶之職。首領官、都目各一員，于本省都吏目選內注授，並從本道帥府節制。湖南道州二處千戶所，于帥府分司處設立，本司調遣。湖北靖州一處，從本省摽撥鎮守調遣。總定九十六員，給降宣敕牌面印信。十三年十一月，立義兵千戶水軍千戶所于江西。
