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朝廷調張廣泗總督四川，進駐澤旺所居美諾官寨，而以其弟良爾吉從征。時莎羅奔居勒烏圍，其兄子郎卡居噶爾厓，地在大金川河東，而河西亦有地數百里。廣泗調兵三萬，一路出川西攻河東，一路出川南攻河西。而河東一路又分為四，以兩路攻勒烏圍，以兩路攻噶爾厓，河西亦分兩路，攻庚特額諸山，刻期蕆事。阻險不前，上命大學士公訥親往視師，起嶽鍾琪於廢籍。鍾琪與廣泗議定，自任由黨壩取勒烏圍，而廣泗由昔嶺取噶爾厓。會訥親至，下令限三日克噶爾厓，總兵任舉、參將買國良戰死。廣泗輕訥親不知兵，而惡其淩己，故飾推讓，實以困之，軍中解體。良爾吉夙與阿扣通，莎羅奔因使成配，倚作間諜，官軍動息輒為所備。師久無功，上怒甚，會訥親劾廣泗，於是逮廣泗入京，而命大學士傅恆為經略，代訥親。冬，殺廣泗，賜訥親死。十二月，傅恆至軍，斬良爾吉、王秋、阿扣以斷內應。
十四年春正月，奏言：「金川之事，臣到軍以來，始知本末。當紀山進討之始，惟馬良柱轉戰直前，逾沃日，收小金川，直抵丹噶，其鋒甚鋭。其時張廣泗若速濟師策應，乘賊守備未周，殄滅尚易；乃坐失機會，宋宗璋逗留於雜穀，許應虎失機於的郊，致賊得盡據險要，增碉備禦，七路、十路之兵無一路得進。及訥親至軍，嚴切催戰，任舉敗歿，鋭挫氣索，晏起偷安，一以軍務委張廣泗。廣泗又聽奸人所愚，惟恃以卡逼卡、以碉逼碉之法，槍砲惟及堅壁，於賊無傷，而賊不過數人，從暗擊明，槍不虛發，是我惟攻石，而賊實攻人。且於碉外開壕，兵不能越，而賊得伏其中自下擊上。又戰碉鋭立，高於中土之塔，建造甚巧，數日可成，隨缺隨補，頃刻立就。且人心堅固，至死不移，碉盡碎而不去，砲方過而人起，主客勞佚，形勢迥殊，攻一碉難於克一城。即臣所駐卡撒山頂，已有三百餘碉，計半月旬日得一碉，非數年不能盡。且得一碉輒傷數十百人，較唐人之攻石峰堡，尤為得不償失。惟有使賊失其所恃，而我兵乃得展其所長。臣擬俟大兵齊集，別選鋭師，旁探間道，裹糧直入，逾碉勿攻，繞出其後，即以圍碉之兵作為護餉之兵。番眾無多，外備既密，內守必虛。我兵即從捷徑搗入，則守碉之番各懷內顧，人無固志，均可不攻自潰。至於奮勇固仗滿兵，而鄉導必用土兵，土兵中小金川尤驍勇。今良爾吉之奸諜已誅，澤旺與賊仇甚切，驅策用之，自可得力。至沃日、瓦寺兵強而少，雜棱、綽斯甲等兵眾而懦。明正、木坪忠順有餘，強悍不足。革什乍兵鋭，可當一路。是各土司環攻分地之說雖不可恃，而未嘗不可資其兵力。臣決計深入，不與爭碉，惟俟四面佈置，出其不意，直搗巢穴，取其渠魁，定於四月間報捷。」上屢奉皇太後息武寧邊之諭，命傅恆班師。時傅恆及鍾琪兩路連克碉卡，軍聲大振，莎羅奔乞降於鍾琪，鍾琪輕騎徑赴其巢，賊大感動，頂佛經立誓聽約束。次日，鍾琪率莎羅奔父子坐皮船出洞詣大軍，莎羅奔等叩顙，誓遵六事，歸各土司侵地，獻凶酋，納軍械，歸兵民，供徭役。乃宣詔赦其死。諸番焚香作樂，獻金佛謝。二月，捷聞，詔賞傅恆、鍾琪等。
既而莎羅奔兄子郎卡主土司事，漸桀驁。二十三年，逐澤旺及革布希劄土司。三十一年，詔四川總督阿爾泰檄九土司環攻之。九土司者，巴旺、丹壩、沃日、瓦寺、綽斯甲布、明正、木坪、革布希乍及小金川也。巴旺、丹壩皆彈丸，非金川敵。明正、瓦寺形勢阻隔，其力足制金川。而地相逼者，莫如綽斯甲布與小金川。阿爾泰不知離其黨與，反聽兩金川釋仇締約，自是狼狽為奸，諸小土司鹹不敢抗。時澤旺老病不問事，郎卡亦旋死，其子索諾木與僧格桑侵鄂克什土司地。
三十六年，索諾木誘殺革布希劄土官，而僧格桑再攻鄂克什及明正土司，與官軍戰。上以前此出師，本以救小金川。今小金川反悖逆，罪不赦。賜阿爾泰死，命大學士溫福自雲南赴四川，以尚書桂林為四川總督，共討賊。溫福由汶川出西路，桂林由打箭爐出南路。僧格桑求援於索諾木，索諾木潛兵助之。三十七年春，桂林克複革布希劄土司故地，溫福克資裡及阿喀。朝廷以阿桂為參贊大臣，代桂林赴南路。十一月，阿桂以皮船宵濟，連奪險隘，直搗賊巢。十二月，軍抵美諾，進至底木達，俘澤旺，檄索諾木縛獻僧格桑，不應。
上命溫福為定邊將軍，阿桂、豐伸額為副將軍。溫福、阿桂奏六路進兵之策。溫福由功噶入，阿桂由當噶入，豐伸額由綽斯甲布入。三十八年春，溫福以賊扼險不得進，別取道攻昔嶺，駐營木果木，令提督董天分屯底木達，守小金川之地。溫福為人剛愎，不廣諮方略，惟襲廣泗故智，以碉卡逼碉卡，建築千計。初索諾木欲並小金川地，故留僧格桑挾以號召。六月，陰遣小金川頭目等由美諾溝出煽故降番使復叛。諸番見大軍久頓，蜂起應之，攻陷天營，遂劫糧台，潛兵襲木果木，奪砲局，斷汲道，賊四面蹂入大營，溫福死之，將士隨員死者數十人，各卡兵望風潰。海蘭察聞警赴援，殿眾由間道退出，收集潰卒，尚萬數千人，其戰歿者三千餘，小金川地復陷。惟阿桂一軍屹然不動，乃整隊出屯翁古爾壟。
上在熱河聞報，召大學士劉統勛詣行在咨之。統勛前言金川不必勞師，至是亦主用兵。乃授阿桂定西將軍，豐伸額、明亮為副將軍。十月，阿桂改赴西路，明亮赴南路。豐伸額仍由綽斯甲布進取宜喜，阿桂入自鄂克什，轉戰五晝夜，直抵美諾，克之；明亮入自瑪爾裡，所向皆捷，遂盡復小金川地。
惟大金川自十二三年以來，全力抗守，增壘設險，嚴密十倍小金川。七月，令諸軍分攻各碉寨，數十道併進。海蘭察率死士六百削壁猱引而上，趾頂相接，比明及其碉，一湧入，盡殲守賊。數十里賊寨聞之皆奪氣，悉破之，乘勝臨遜克宗壘。索諾木酖殺僧格桑而獻其屍，及其妻妾頭目，至軍乞赦己罪。阿桂檻送京師。四十年四月，阿桂先使福康安、海蘭察赴河西助明亮攻宜喜，遂分兵六路，盡滅河西二十里內之賊。五月，阿桂河東之軍破朗噶寨，距勒烏圍僅數里，環營進逼其巢。七月，抵勒烏圍。八月十五夜，進搗賊巢，四面砲轟官寨，破之。黎明，克轉經樓，逸賊皆溺水死。莎羅奔兄弟及各頭目已先期遁往噶爾崖。十一月，官軍攻克科布曲山。十二月，遂據瑪爾古山，噶爾崖即在其下。索諾木之母姑姊妹亦降。官軍三路合圍噶爾崖，斷其水道。索諾木使其兄詣營乞哀，不允。圍攻益急，索諾木從莎羅奔及其妻子挈番眾二千餘出寨，奉印獻軍門降，金川平。四十一年正月，獻俘廟社，封賞阿桂等，勒碑太學，並及兩金川。旋於大金川設阿爾古，小金川設美諾。四十四年，並阿爾古入美諾，改為懋功。
同治二年，粵匪石達開竄寧遠，假道工卩部土司。土司先受官軍約束，引賊至紫打地。四面阻絶，達開糧罄路窮，射書千戶王應元買路，復使人說土司嶺承恩求緩兵，皆不應，日殺馬煮桑葉為食。四月，承恩、應元等偵賊力竭，率夷眾蹙攻，擒達開並賊官五人付官軍，檻送成都，四川總督駱秉章誅之。奏加承恩、應元二品銜，賊軍錙重悉為兩土司所得。
初，瞻對土司恃強不法，雍正八年，四川提督黃廷桂剿降之。乾隆十年，四川提督李質粹等率兵五千，取道東俄落，至裡塘進兵，連破番寨，獲賊首噶籠丹坪。十一年，質粹會欽差大臣班第，統兵進克泥日寨，燒斃番酋姜錯太，撫定丫魯、下密等處番夷。嘉慶十九年，中瞻對土司洛布七力劫掠鄰番，抗捕傷兵。二十年，四川總督常明、提督多隆武領兵剿之，恃險死拒。重慶鎮總兵羅思舉力戰破其巢，洛布七力焚死，分其地入上下瞻對。
洎鹹豐中，土司工布朗結為人沉鷙，兼併上下瞻對之地，欲擁康部全境以抗川拒藏，鄰近各土司割地求免，貢賦唯命。至是藏人怒，求四川出兵，秉章派道員史致康率師會藏進討。致康怯，頓打箭爐久，藏番需茶急，馳兵克之，殺工布朗結父子，致康始逡巡至。藏人索兵費銀十六萬兩，秉章未允，藏人因據其地，設官兵駐守。
