按事先安排好的計劃應由馬林科夫總結並宣佈對貝利亞的處置，但是事到臨頭，馬林科夫臨場由於心情緊張不知所措，致使會議長時間地停頓。貝利亞利用這個空隙將手伸向他放在室小桌的公文包。赫魯曉夫見勢不妙，立即使勁地按了一下秘密電鈕，向隔壁房間發出了信號。
朱可夫等將帥立刻衝進會場，用手槍對準貝利亞，並從他手中奪下公文包，打開一看，裏邊恰有一枝白朗寧手槍，子彈已上膛。
馬林科夫用一種微弱的聲音向朱可夫說：「作為蘇聯部長會議主席，我要你們把貝利亞先關進監牢，以待調查對他進行的控訴。」
朱可夫怒視貝利亞，大聲喝道：「舉起手來」隨後，所有元帥和將軍們都打開了他們的手槍皮套，以防貝利亞的反抗。貝利亞及其同夥一開始被秘密關在莫斯科軍區院內「魔窯」裡，直到
1953年
12月
24日才宣佈對他們處以死刑。
貝利亞事件後，朱可夫被提升為黨中央委員會的正式委員。揭露和處決劊子手貝利亞以後，朱可夫在軍隊地位才得到徹底恢復。
1955年，連一級取消了政治軍官的職位，取而代之的是一長制的推行。
朱可夫元帥從來沒有動搖過「軍事一長制」的立場。他始終認為，國家的文職當局必須放手讓軍事首長來處理部隊的事務，而不要讓政工幹部來干涉。他痛恨那些不正派的政工人員，「成事不足，敗事有餘」。
在朱可夫這一堅定而又大膽的觀念指導下，蘇聯的軍事進入了一個新時代，軍事指揮員再次成為惟一出頭露面的顯赫人物。
1955年
2月，朱可夫接替布爾加寧的職務，擔任了國防部長。
1956年
1月，在莫斯科軍區一次黨的會議上，朱可夫極力強調要維護軍事首長的特權，他說：「在莫斯科軍區，有人企圖對司令的正式活動在黨的會議上加以批評。這種企圖是應該受到譴責的。我們的任務是對指揮員權力予以全面加強，對於嚴格要求部下的軍官和將軍要給予支持。」
後來，朱可夫在另一次政工會議上，他強調地說：「宣傳的任務不僅在於解釋馬克思主義、列寧主義的理論，而在於要對實際工作的執行做出貢獻。一個不懂得軍事責任的政治官員，就不能應付他面臨的各種任務」。
1957年
4月，蘇共中央根據朱可夫的建議，公佈了一項《對蘇聯陸軍和海軍中黨組織的指令》。這份材料對黨在軍隊中的地位，採取了抽象肯定，具體否定的辦法。
在具體指令中，卻規定了「軍事司令對軍事訓練和政治訓練兩方面都要負責，不容許在黨的會議上對司令的命令和規定提出批評」。這一內容，顯然是朱可夫思想的具體體現。
在朱可夫這種主導思想影響下，許多軍事指揮員對政治學習、思想教育和黨的領導越來越不感興趣。他們都集中精力從事軍事專業，掌握新的、複雜的軍事技術和探索未來戰爭的手段和方法。軍隊中的政治幹部無形中受到了冷遇，人數鋭減。政治機關的權限也受到限制，政工幹部只是副職，是軍事首長的助手。
軍隊中政工幹部的地位越來越下降了，使它的職能僅僅侷限在政治教育方面。
朱可夫極力推行單一首長制，不管其最終目的是什麼，但客觀上則明顯地削弱了黨對軍隊的領導，否定了黨的工作人員的地位和作用。這不能不引起蘇共中央第一書記赫魯曉夫的警覺和不滿，因為他自己的權威正是建立在黨的各級權力基礎之上的。但是史達林死後，繼承權的鬥爭還沒有獲得最後結果，朱可夫的支持還舉足輕重，赫魯曉夫不會為此與朱可夫攤牌。相反，他對朱可夫給予了最大的尊敬和特殊的待遇，並將他選進最高蘇維埃主席團。
隨着朱可夫地位的上升，他在軍隊中的影響也越來越大，他的思想得到了最有效的貫徹。
根據現代戰爭的發展趨勢，朱可夫決定加速發展遠程航空兵，加強空軍遠程攻擊力量和核武器力量。與此同時，他也強調大規模的陸上作戰的重要性。他說：「空軍與核武器本身並不能決定武器衝突的成敗。儘管原子武器和氫武器具有巨大的破壞力，在戰役中不可避免地還要使用大量陸軍部隊和大量的常規武器與之相配合。」
朱可夫擔任國防部長以後，不僅經常發表文章，照片也多見諸報端，所有重要會議和事件，都少不了他的身影，在黨的主席團中他也常居顯要位置。他似乎已成為蘇聯的政治領袖之一。人們注意到，在他之前還從來沒有一個職業軍人能在政治上升到如此高的地位。
3陷入政治鬥爭的漩渦
1956年，在蘇聯共產黨第二十次代表大會上，赫魯曉夫做秘密報告，徹底揭露史達林搞肅反擴大化造成的嚴重後果，攻擊史達林的獨裁與專斷，使他獲得了不少政治資本。赫魯曉夫不僅否認了史達林在軍事上的天才神話，而且把許多榮譽歸還給了那些著名的軍事將領。
赫魯曉夫採用實用主義的政客手法，肉麻地獻媚和別有用心地拉攏朱可夫，他拍着胸膛大聲疾呼：我從來都反對史達林對朱可夫的譴責和貶謫，我始終把朱可夫當做忠實的朋友……”朱可夫也投桃報李。
1957年
4月，他幫助赫魯曉夫清除了馬林科夫集團，使赫魯曉夫穩固了自己的權力。然而，隨着個人權力的鞏固，赫魯曉夫對這位功高蓋主的老元帥不放心起來，特別是朱可夫不斷地在報紙雜誌上發表文章，表白他在衛國戰爭歷次戰役勝利中的重要作用，更引起了赫魯曉夫的猜忌。
「朱可夫想幹什麼？」這個問題不斷在赫魯曉夫的腦子裡打轉轉。
「不管怎麼樣，不能讓朱可夫為所欲為。」赫魯曉夫暗下決心。
