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「按照我的意見，你應當負責陸軍的工作。我們認為，陸軍應有一個總司令。你不反對吧？」史達林言不由衷地說。
「同意。」朱可夫立刻回答。
「很好，同布爾加寧、華西列夫斯基一同回莫斯科，先在各自的職務上同人民委員部領導成員工作一段時間。」
1墜入深谷
1946年
4月，朱可夫躊躇滿志地告別了柏林市，告別了生死與共的戰友們，回到了蘇聯去迎接命運的無情挑戰。
朱可夫深知，在硝煙瀰漫和槍林彈雨的戰場上，他可以駕馭戰爭，運用自如，可在政治鬥爭的漩渦中並不如他在軍事上指揮打仗那樣能運籌帷幄、穩操勝券。特別是他那種敢於堅持真理的倔強、豁達的性格，大膽果斷的處事作風，再加上獨特和創造性的工作方式，使他與史達林本人貫有的武斷專橫、沉醉于個人崇拜的作風難以相融。
4月
10日，朱可夫離開柏林，回國就任蘇聯陸軍總司令之職。可是到了
7月份，《真理報》卻莫明其妙地刊登了一則消息：「朱可夫被調到敖德薩軍區，擔任一個不重要的職位。”這則消息傳開以後，外界的傳聞和猜測沸沸揚揚。有的說，朱可夫由於驕傲自滿，和史達林頂撞失去了史達林的信任；有的說他看不起國防部長布爾加寧一心想當國防部長；也有人認為朱可夫不存在失寵的問題，他另有重任派往中國，幫助中國共產黨解放全中國；還有的說，朱可夫被派到敖德薩，是為了向伊朗、中東和希臘進軍做準備。
艾森豪威爾得知老友朱可夫突然隱沒，他分析道：「人們對於他實際上已不公開出面所推測的原因之一是：他與我有人所共知的友誼。我不相信這是原因。因為儘管有這種友誼，但是他似乎始終深信共產主義學說根本上是正確的。他知道我是共產主義的不共戴天的敵人，因為我認為它是獨裁的同義詞。
我向他說，我憎恨每一種有國家統治主義味道的東西，我們整個西方傳統就是獻身于個人自由的觀念。我說這些時，他總是耐心地聽著。但他自己對共產主義的堅信，似乎是出自內心的信念，而不是由於任何外界的強迫。」他意味深長地說：“我們既是朋友，又是敵人。」
隨着時間的推移，真相逐漸大白於天下。朱可夫突然被貶，據說主要有三個原因：一是「功不該蓋主」，戰爭結束後，史達林作為最高統帥，他在取得第二次世界大戰勝利中的作用和地位是絶對不能受到威脅的。以專斷著稱的史達林不能容忍他周圍的人因名望太高而喧賓奪主。
這正如在朱可夫當時出席的一次黨的會議上所發生的情況那樣，會議主席粗暴地大聲對朱可夫嚷道：「我們勝利的功勞不屬於你，而屬於黨及其領袖！」；二是朱可夫對於史達林貪天功為己功，把戰爭的勝利完全歸功於他自己的天才，越來越輕蔑，以至到了十分厭惡的程度，在一些場合他公開流露了這種不滿情緒。秘密警察把朱可夫的言論報告了史達林。三是朱可夫歷來主張一長制，輕視黨和政治工作在軍隊中的地位和作用。在戰爭時期，史達林曾對堅持搞一長制的朱可夫做了讓步，在軍隊中取消了政治委員。
現在史達林再也不能容忍朱可夫那排斥黨政工作的態度。另外史達林還有一個用意即撤去朱可夫的重要職務，可以起到「殺一儆百」的作用，從而嚇唬住那些不聽召喚的將領們，使他們始終與自己保持絶對一致。事實證明，史達林的這一手是成功的，在之後的多年中，蘇聯最高統帥部始終處于安分守己明哲保身的狀態。
當朱可夫離開僅僅坐了三個月的陸軍總司令的交椅後，頂替他的是與他有宿怨的老對手科涅夫，科涅夫取代朱可夫喜出望外，可朱可夫則感到憤懣和不平。
史達林這時對朱可夫的態度非常惡劣，他極力貶低嘲笑這位被他當年稱作為「勝利的象徵”的副統帥。赫魯曉夫在
1956年的蘇共第
20次代表大會上詳細披露了史達林對朱可夫的攻擊和謾罵，他說：「更為可恥的是，在我們付出了巨大代價，取得了偉大勝利之後，史達林開始將許多對取得勝利有很大貢獻的指揮員加以貶低，因為史達林把在前線取得的成就完全歸功於他自己，而不許歸於任何別人。」「史達林曾經對朱可夫同志作為一個軍事領袖應如何評價很感興趣。他時常問，我對朱可夫的看法。
於是我告訴他，『我認識朱可夫已經很長時間了，他是一個優秀的將軍，一個優秀的軍事領袖。』」「戰後，史達林開始講些關於朱可夫的各種無稽之談，例如他說：『你曾經讚揚過朱可夫，但是他不值得讚揚。據說在每次戰役開始之前，朱可夫總是做出這樣的動作：他取一把泥土，嗅一嗅，然後說——我們可以開始攻擊，或者相反地說——原來計劃的戰役不能進行。』當時我就問：『史達林同志，我不知道這是誰捏造的，但這是不真實的。
』」“可能是史達林自己捏造了這類事，為的是要貶低朱可夫的作用，低估他的軍事才能。」
走倒運的朱可夫萬萬沒有想到，
1946年的失意還不是他下坡路的終點。他在敖德薩住了兩三年後，又被調到烏拉爾軍區更為低下的工作崗位，對他而言，這更是雪上加霜。
朱可夫這一次的落難，起因于當時任蘇聯武裝部隊監察部長的戈沃洛夫元帥的報復。在戰爭年代，當列寧格勒被德軍圍困之際，作為最高統帥部代表的朱可夫與當時任列寧格勒方面軍司令的戈沃洛夫在作戰意見上發生過一些衝突。由於戈沃洛夫堅持自己的錯誤意見，朱可夫當時嚴厲地批評了他。對此，戈沃洛夫長期懷恨在心。
