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「比格爾」號考察隊對圍繞在聖克魯斯河上游河谷周圍的階地所做的一些斷面剖析研究，表明階地或者平地曾存在於大陸的深處。這證明了大陸的普遍上升佔有很大的空間，並且在海岸受到經常的剝蝕，海深入陸地時，這種上升時常被長期的靜止狀態所中斷。階地的跡象和階地的峭壁，和現代海岸的峭壁有着同樣的性質。
關於靜止期間海岸的上升是不是突然的、災變的，或者是緩慢的、逐漸的問題，被達爾文出色地解決了，這對第二種假設有利。他對沿著聖克魯斯河入海處及在此以南到福克蘭群島的海岸的各種深度海底的研究清楚地表明，海底的卵石隨着深度和離海岸距離的增加，在數量上迅速而有規律地在減少。如果上升是突然的，我們就會看到斜坡上出現礫石的情景；但是，在那裡沒有發現卵石的數量有任何減少。這是同陸地逐漸地、不大明顯地上升的理論比較一致的。
這樣，達爾文就駁斥了著名的災變論者道比尼所竭力證明的美洲各海岸是突然上升的觀點。
該書的另一個特點是對岩石進行詳細的考查，對礦物的產生和岩石的形成經常進行頗有創見的分析。
最後該書第三個特點是，達爾文堅決摒棄任何具有引用聖經和宗教觀念的形式的說明。
5《蔓足亞綱動物專集》蔓足類，或蔓足亞綱蟹，是極為特殊的。這些大海生形態的幼蟲，對於低級的甲殼綱來說，是所謂無節幼蟲典型的六條腿浮游形態。這個無節幼蟲後面長了很多小腿，後來變為蔓足亞綱更為複雜的幼蟲，幼蟲增加了兩片鱗，好像一個介形目的小蟹，這個幼蟲用它的觸鬚固定在任何一個培養基上，並再次蛻變為成年的「固定」動物，也就是牢牢地固定在培養基上的動物。軀體上的小腿長成觸鬚一般，該類的名稱「蔓足亞綱」就是由此而來。
而有些類型則好像被小塔一般的石灰質薄片圍繞起來。在激浪地帶，被大量膠狀物質固定在陡峭的海岸上的海中橡實就是這樣。為了弄清他所發現的新蔓足動物的構造，為了做出比較，達爾文開始解剖和研究整個一類。這部著作花了他整整
8年細緻而頑強的勞動。
達爾文的孩子們由於習慣把父親看作一個忙於製造海生橡實的人，以至有一個孩子問莊園的一位鄰居：「您在哪裡製造您的海生橡實呢？」因為他天真地認為，不僅他父親，而且任何其他人都要研究這一類。
達爾文研究蔓足亞綱動物，是從
1846年
10月開始的。從前他在智利海岸邊時，發現一種極其稀奇的類型，它在茗荷狀螺的殻上鑽孔，寄居其中；它的形狀完全不同於蔓足亞綱的其他各個種，因此達爾文不得不單獨把這個類型分離出來，另立一個新的亞目。不久以前，在葡萄牙的海灘上，有人發現一個類似的鑽孔寄居的屬。為了搞清楚新發現的蔓足類新種的構造，達爾文感到必須去研究和解剖許多普通的類型，就這樣他把全部蔓足亞綱動物都研究了一遍。
出版了兩大卷記述現存的所有各種蔓足亞綱動物的厚書，還出版了兩卷記述化石蔓足亞綱動物的四開本較薄的大書。
達爾文自認為他在《蔓足亞綱動物專集》方面的研究工作有相當的價值，因為他除了記述幾個奇異的新類型以外，還查明了它們身體各部分的同源；發現了膠器，不過在膠腺方面犯了嚴重的錯誤；最後還證明了其中幾個屬具有微小的外雄體，它們寄生在雌雄同體的個體內。後面這個發現，最後獲得了完全的證實。蔓足亞綱動物包括的種群極不相同，很難加以分類；達爾文這次工作，對他在《物種起源》一書中探討分類原理方面，就有了相當的好處。
第十章 《物種起源》問世達爾文多年來一直在準備着編寫物種一書，究竟要準備多久，很難說準，因為達爾文總是同時進行着幾種計劃。一個計划行不通，就着手另一個計劃。從 1854年9月起，達爾文把全部時間都用來整理大量有關物種變異問題的筆記，同時還進行了觀察和試驗工作。他在「比格爾」號艦的航行期間，看到一些深受感觸的事實：第一，在潘帕斯地層中，發現了龐大的動物化石，它們具有背甲，同現在生存的犰狳的背甲相似；第二，動物的親緣關係相近的種，隨着南美洲大陸自北向南逐漸發生一定的交替變化；第三，加拉帕戈斯群島上的大多數生物，都具有南美洲生物的性狀；更加特別的事實是：這個群島中的各個島嶼上的同種生物，其性狀卻也彼此略有差異；從地質意義上看來，其中任何一個島嶼都不是古老的。
顯然可知，只有依據一種推測，就是物種在逐漸地發生變異，才可以去解釋這一類事實以及其他很多事實；因而這個問題一直縈繞在他的腦際。可是，同樣也明顯可知，不論是周圍環境的作用，或者是生物的意志，特別是在植物的情形方面，都不能夠解釋各類生物極其良好地適應于自己的生活習慣這無數的事例，例如：啄木鳥和雨蛙對於爬樹的適應，或者一粒種子以它的刺鈎或簇毛來用於對傳播的適應。這些適應情形，時常使達爾文感到驚奇不止；他以為，在它們還得不到解釋以前，要採用間接的證據去證實物種曾經變異這個企圖，几乎是不可能的。
