第22頁
因此，韋克姆只有完成對南美洲東南部的測量工作，然後才能帶領「比格爾」號返回英國。但全體船員都願意經太平洋返回。這只有在費茨羅伊指揮下，根據以前給他的指示才能辦到。而受海軍部欺侮的費茨羅伊大為惱怒，他不能好好地並且按他過去的希望的那樣去完成對南美洲東西部兩岸的測量工作，所以他堅決要求辭職。
如果艦長辭職，韋克姆就會得到晉陞，可是韋克姆不管這一點，他還是勸說費茨羅伊撤回自己的辭職書。他勸說艦長，海軍部的指示，本身就是命令。他有多少剩餘時間就做多少測量美洲西岸的工作，然後再橫渡太平洋。韋克姆警告艦長說，即使他費茨羅伊擔任了指揮，也不會有任何力量能使他重返火地島。
韋克姆問艦長，他的辭職會有什麼好處呢？如果在一定時間許可的範圍內他能完成測量工作，然後再往太平洋去的話，不是更好一些嗎？最後令大家高興的是，艦長被說服了，並撤回了自己的辭職書。
從達爾文給親屬的信中可以看出，「比格爾」號上這次危機使他多麼焦急不安。當然，一方面他特別懷念故鄉、家庭和朋友。考察，特別是航海旅行愈來愈艱苦，使他疲憊不堪。如果費茨羅伊拒絶指揮，「比格爾」號就要被迫抄近道由大西洋返回。
達爾文自然也就應該結束在「比格爾」號上博物學家的工作，考慮的只是回去的事了。然而他頭腦中卻有着另外的打算。
14危機結束對收集來的材料進行研究，特別是對南美洲的地質考察情況已開始形成一定的構思，都向他提出了新的任務：首先就是要對西部各海岸進行地質考察，特別是科迪勒拉山脈的地質學問題。仔細觀察自然景象的旅行者的最初熱情，對迷人的熱帶風景的興奮心情，漸漸地為考察家所具有的那種特別平心靜氣的濃厚興趣所代替，因為考察家竭力要做的不僅是儘可能多收集蒐集物，不僅是要記錄他所觀察到的現象，而且還要更好地弄懂和解釋這些現象。旅途中，他在費茨羅伊艦長藏書豐富的圖書館裡，熟悉了許多南美環球旅行的情況後，給自己擬定了未來工作、未來旅行路線和考察一些新地區的計劃。他不能使自己的事業半途而廢，不能放棄自覺制定的計劃，特別是快要完成的計劃。
要是「比格爾」號放棄環球航行的計劃向英國駛去的話，達爾文就決定走他自己所擬定的航線，獨自越過科迪勒拉山脈，研究科迪勒拉山脈的地質，走旱路橫穿南美洲大陸，再返回東岸到布宜諾斯艾利斯去，然後從那裡乘船回英國。
可是危機結束了，「比格爾」號決定在完成能發現新地方的誘人的環球航行之後再回英國。同時達爾文決定要更加努力在南美洲西岸進行工作，乘「比格爾」號到一些島嶼上去考察，廣泛利用在大陸上所用的老辦法，即僱傭嚮導、馬匹和騾子，走完所擬定的行程。他始終沒放棄越過科迪勒拉山脈的念頭。
「比格爾」號全體船員又開始進行測量奇洛埃島的工作。有幾個人在謝利萬的指揮下，于
11月
24日乘着舢板和高速艇前去考察該島的東部。達爾文僱了幾匹馬，到島北端的查卡奧，他要在那裡與其他人匯合。另一部分船員則留在「比格爾」號上，他們應該去考察島的西部，以便與第一隊人馬在南部匯合。
這時「埃德文切爾」縱帆船已賣掉。達爾文騎馬走的路都是用圓木橫鋪而成的。因為太陽光線穿不進常綠森林的葉叢下面，所以地面鬆軟、泥濘。
15狐 狸查卡奧本是島上的主要港口，因為在海峽裡的急流和危險的岩礁中間船隻經常失事，所以人們就把港口移到聖卡爾洛斯。達爾文在查卡奧遇到了第一隊人馬。在以後的日子裡，這隊人馬就逐漸地往南推進。被河谷切割開來，分離成很多小島的平坦的地方，完全被一片不能通行的深綠色的森林覆蓋起來。
有些地方可以經常看見茅屋。在這片大陸上，現出了三座正在噴出一團團濃煙的巨大的活火山。每座火山的高度都有
2000米左右。安第斯山脈本身在這裡要比在瓦爾帕萊索附近的山脈矮得多。
沿途所見的居民，就外貌來看，都是有着紅銅面孔的典型的純種印第安人。他們住得很分散，對沿海地帶上的樹木很少清除或者清除得很差。
11月
31日，這隊人馬來到了卡斯特羅，它曾是奇洛埃島的古都，但是當時已經變成了一個特別荒涼的地方，總共只剩下幾百個居民。
達爾文特別注意到植物當中的龐克，龐克這一植物的基幹有一米多高，長着四五個齒狀的圓葉子，直徑超過
2米，周長在
6米以上。
12月
6日，這隊人馬到達了南島聖佩得羅，「比格爾」號已停泊在那裡。當這隊人馬中的兩名軍官，在這裡用經緯儀進行測量工作時，據說是這個島上特有的一隻狐狸正在聚精會神地注視着軍官們的工作，因此達爾文偷偷地走到它的背後，用地質錘朝它頭上重擊一下，把它打死了。就這樣，在這個島上發現了獨有的狐狸。
達爾文和費茨羅伊雖然努力要爬上島巔，但是一切努力都白費了：由於森林中到處都堆積有大量倒下的腐朽的樹，所以根本無法通過，他們只好時而一個跟一個從腐爛的樹幹底下爬過去，時而沿著離地二三米高的樹幹上走。最後只好放棄這一打算。
16高山眺望
12月
10日，達爾文搬到要繼續向南駛進的「比格爾」號上。
13日，他到達了喬諾斯群島，那裡開始颳起了可怕的「不亞於火地島的」風暴。
