屍體解剖完畢，其餘人都離開了，安東馬爾西又讓馬爾商幫助，測定了屍體的各種數據，並將解剖發現記錄在案。幹完這一切，馬爾商才又為拿破崙的遺體穿上喪服。如他後來在他所寫的回憶錄中所記述的，他在另一位侍從的幫助下，給拿破崙「穿上了帝國衛隊輕騎兵的全套制服。我們給他穿上了一件白色的襯衣，戴上一條穆斯林的白色領帶，並在領帶上套上了一條黑色的絲質衣領。
用扣子在背後把衣領扣緊，他的腳穿了白色的絲襪，穿了齊膝深的白色開絲米的騎馬褲和一件同樣質料的背心，外面套上整齊的帝國衛隊輕騎兵的制服，制服上綴滿了各種榮譽勛章——這些勛章都是拿破崙在世時設置的，其中有『鐵十字勛章』，『聯合勛章』——腳上套着騎馬靴，頭上戴着三色徽章的禮帽。」
下午
4點，即屍體解剖開始之後兩個鐘頭，馬爾商和其他的侍者把皇帝的屍體搬回他的寢室，重新安放在他死去時躺的那張行軍鐵床上。
那幅停放過拿破崙屍體的血跡斑斑的被單，被馬爾商和其他侍從剪成碎塊，作為皇帝的遺物予以瓜分。
屍體解剖後，醫生們並不能在一份寫成的檔案中對拿破崙的死因取得一致的意見。
7位醫生分別交出了
4份解剖報告。他們一致同意的只有一點：在拿破崙的胃部靠近幽門外
也就是胃的張開部分與內臟接觸的地方發現有一處潰瘍，安東馬爾西醫生稱這個地方為「致癌性的潰瘍」，那些英國醫生則發現是「硬性癌引起的癌症」。這個說法導致了日後流行的這樣一個見解：拿破崙是因為胃癌或幽門癌而死的，因為拿破崙的父親就是死於幽門癌的。
但是，並沒有一位醫生能指出一個實際的癌病灶來。不過，這樣一種見解，正好解脫了赫德森·洛和英國人的責任，拿破崙將被認為可能是死於一種遺傳性的胃癌，因此，聖赫勒拿島的氣候，不能對他的死負什麼責任。
但是那
6位英國醫生中，有一位叫托馬斯·索特的，還發現了死者的肝「腫大」。這正是赫德森·洛在平時所猜忌過的，因而也是他不願聽到的消息——因為肝病正好支持了這樣一種理論：拿破崙的死是由聖赫勒拿島的氣候引起的肝病造成的。於是英國總督把索特醫生喚到他的辦公室去，命令他把他的報告中與官方的意圖相牴觸的部分刪掉，索特勉強同意了。但他後來平安地離開了聖赫勒拿島時，又把當時的情況如實說了出來。
像索特一樣，安東馬爾西醫生也發現拿破崙的肝臟異常腫大，雖然他並沒有在肝臟中發現什麼毛病。安東馬爾西認為，英國人對拿破崙的死是負有責任的，因為海島的氣候太惡劣了，他也把這個見解說了出來，總督赫德森·洛沒有權利可以使拿破崙的私人醫生保持沉默。
3天後，也就是
5月
9日，拿破崙被埋葬在聖赫勒拿島的一個山谷裡。
又過了半個月後，拿破崙的隨從們登上了一艘「駱駝號」的英國船，離開了大西洋南部的這座几乎渡過了
6個年頭的孤島，開始回到歐洲去。
當「駱駝號」在海上航行到第五十九天，即
7月
25日時，船長告訴蒙托龍，說船已進入歐洲水域，這正是拿破崙安排好拆讀他遺囑的時間。
於是蒙托龍將馬爾商、貝特朗、神父安格羅·維格等人叫進他的艙房，當着大家的面刮掉他手裡一份檔案的封蠟，用欽差宣讀聖旨一樣的聲調，高聲流利地朗讀了拿破崙的遺囑。在這份遺囑中，拿破崙將自己的遺產部分贈給了那些與他共過患難的下屬作紀念。就連他記憶所及，在他的事業的早期階段為他服務過的人們，也得到他的一筆較小的遺贈。
在拿破崙身邊服務的侍從，如馬爾商等人，都得到了拿破崙不薄的遺贈。
經過兩個多月的航行，駱駝號即將到樸茨茅斯下錨了。一路上來，馬爾商負責保管着
3隻密封的紅木箱子，裡面裝着拿破崙的私人財物，包括他的幾束頭髮。待馬爾商回到歐洲時，他將把這些遺物分贈給拿破崙的直系親屬。而馬爾商自己，也還保存了幾件屬於他的紀念品。
拿破崙留下的這份遺囑，對那些把他送到大西洋這個孤島上去送死的人們也進行了最後的一次打擊，其中也包括對他的監守者——英國總督赫德森·洛的攻擊。拿破崙在遺囑中寫道：「朕死得太早了。朕是被英國的政治寡頭和它的幫凶們謀殺的。」
拿破崙遺囑中的最後控訴，在整個歐洲引起了強烈的反應，當馬爾商一行人在樸茨茅斯上岸後，許多英國人都友好地圍着他，向他熱切地提出許多有關聖赫勒拿島的問題。馬爾商在熱情的英國人中間移動着，他得出了這樣的結論：這些英國人必定是反對他們本國政府對待拿破崙的方式的。其實，在英國的自由主義者裏邊，早年就有一股對法國革命的化身拿破崙表示讚許的潛流存在。現在拿破崙死了，對他說幾句好話也沒什麼危險。
不過，拿破崙死後的消息傳到後，英國政府的股票價格卻上升了不少。
拿破崙的死訊傳出去後，他的親屬也都感到很悲痛。在巴馬，那位奧地利公主瑪麗·路易絲得到丈夫逝世的消息後，選在
8月
15日舉行了一天悼念儀式，因為這一天正好是拿破崙
52歲的生日。拿破崙
10歲的兒子和繼承人——小羅馬王，聽到父親逝世的消息便無聲地飲泣着。
在羅馬，拿破崙的母親聽到兒子的死訊，開始還不相信。因為幾年前，有位消息靈通人士說拿破崙不在聖赫勒拿島而到別處去了。等到她證實兒子死訊是確信無疑時，便昏了過去。兩星期後，她寫信給英國外交部長卡斯爾雷，要求將她兒子的屍體送回來，卡斯爾雷置之不理。
