10月
24日，慶喜再次上表，提出辭去征夷大將軍的頭禦。此前他提出的辭職，是辭去執政之事，並沒有辭去將軍的地位。所以即使奉還了大政，依然擁有大將軍之頭銜。這回乾脆一辭到底。
27日，攝政二條退回了辭呈。說如此重大的事情，將在最近召開的諸侯碰頭會上作出決定。請他稍待些時間。
這次諸侯碰頭會，是專門為了填補慶喜的大政奉還後出現的權力真空而籌劃的。雖然口口聲聲說大政已經奉還，幕府一方來個撒手不管，朝廷一方則還是一個空架子，完全不知下一步如何搞法。
其實，這段真空時間雙方都不知道如何是好。
朝廷召集年俸在十萬石以上的諸侯，進宮去議政，計劃今後的大政方針。特別指名要求尾張藩的德川慶勝、越前藩的松平慶永、佐賀藩的鍋島齊正、土佐藩的山內豐信、宇和島藩的伊達宗城、廣島藩的淺野茂長、岡山藩的池田茂政、薩摩藩的島津久光等，社會上稱之為賢侯或準賢侯的人物，一定到京參與碰頭會。
誰知屆時應召與會者寥寥無幾，其中大有文章。
明石、赤穗、群上、大溝諸藩，推說藩主生病，要求允許老臣代其出席。
浜田藩、須阪藩、黑石藩等，也以生病為由，明確地謝絶赴會。
莊內藩、姬路藩、忍藩、三河吉田藩、浜松藩、岡崎藩聯名寫信，宣佈把自己的官位退還朝廷，與幕府將軍同進退，以明臣屬於德川家之義。
岡部藩、伊勢崎藩以下
24藩，也聯合署名拒絶召命。
再以下，相繼不聽召命的各藩，都宣誓效忠德川家。
高田藩辭去朝命，說如獲得許可，將奉還官位。
平戶藩、久留米藩，以及另外的一些藩，說是山高路遠，趕不上會期，請予原諒。
還有京都的朝臣中，也有不少人偏袒德川派。他們不喜歡革新派，認為岩倉一夥人有野心，在玩弄陰謀。所以左大臣近衛忠房和右大臣一條實良，也稱病提出了辭呈。這一來朝廷就被岩倉等人控制，左右大臣名存實亡了。
全國三百路諸侯，至此紛紛亮相，基本陣線分明：大部分抵制碰頭會。而其中有一半是鐵桿保幕，以貫徹對德川家的信義；另一半態度曖昧，以謀騎牆觀望，靜觀事態之發展，再決定倒向何方。
但是另一方面卻是，雖然通知中止實施討幕密敕，薩摩和長州兩藩，根據先前的密約，兵力業已出動。
11月
29日，長州派出兵力
1200人以西宮為陣。而且接着又派出
1300人作為後續部隊，從尾道東上。
薩摩藩的世子島津茂久，率領一萬大兵入京。廣島藩也出兵支援他，一時間在京都以西，駐滿了薩、長、藝三藩的兵馬。
議奏正親町三條實愛，到處去遊說活動，給攝政施加壓力。因此攝政讓各藩先到大阪會合，等待下一步的指示。也就是說，同意他們進入大阪。這對以會津和桑名兩藩為首的擁幕派來說，這個裁定令他們不滿意。
以岩倉具視為首的革新派朝臣們，以為需要早下手為強，以便造成王政復古的既成事實。
勤王派策劃，把
12月
9日定為王政復古大號令之日。一切準備工作，均極端秘密地進行。他們首先使用尾張、越前、藝州以及薩、長五藩之兵，日夜固守宮門，絶對阻止非討幕派的朝臣進宮。
當天早晨，按照商量好的步驟，中山忠能、正親町三條實愛、中禦門經之、岩倉具視四人，同在禦書房伺候。上奏說，已經得到聖斷的王政復古，于今日起斷然實行。
遵照傳統儀節，天皇睦仁落坐在高台上。上身穿白紡綢，下身着緋紅色套裙。他的臉上化了淡妝，點了口紅。在日本宮廷裡，男子化妝成女性，這是平安朝以來的規矩。
頭髮從正中間分開，在左右的耳下邊打結，是髮梢下垂的全發。頭髮長得長長的，一副兒童髮型的樣子。
在睦仁前邊列坐的，有棲川宮熾仁親王、仁和寺宮純仁親王、大原重德、萬里小路博房、島津茂久、山內豐信等人。
睦仁面對眾臣僚，用清晰的聲音宣告：「在接受將軍慶喜奉還大政的同時，重新實行王政復古。」
與此同時，停止了朝彥親王、二條攝政等反對派
21人的入宮朝覲。
免去會津、桑名兩藩的禁門守衛，改派前述五藩的部隊警衛皇宮。
王政復古大號令一發佈，乾坤如此一顛倒，正所謂昨日的官兵今天成了賊寇；昨日的賊寇今天成了官兵。
在王政復古大號令發佈之前，雖說口頭上講大政奉還，慶喜依然是德川家第
15代將軍，幕府依然是現實的存在。朝廷即使下命令，各路諸侯未必就服從。
當天傍晚，在宮中小殿裡，召開了一個會議。議題只有一個：今後如何處置前大將軍慶喜。
在高台的帘子背後，端然坐著睦仁。那裡面光線朦朧，營造出一種神秘的氣氛。
會議開始，中山前大納言簡短致詞，接着進入議事主題。土佐藩的山內容堂大聲發言說道：「在今天的會議上，怎麼看不見德川內府
慶喜，會津中將
容保，桑名越中守
定敬呢？這是怎麼回事兒？”大原宰相
重德說道：“德川內府雖然提出了大政奉還，其動機是出於勤王之至誠呢，還是矇混一時，極其可疑。所以王政復古的大業，暫時不讓他參加，我以為是恰當的。」
山內粗聲粗氣地反駁：「這是有欠公平之事……」這位外號鯨海醉侯的土佐藩主，從一清早晨起就帶著酒氣。猛喝了一頓之後，閙着非要參加開會不可。後藤象二郎為了安撫他，才把他帶來開會的，現在發起了酒瘋。
