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順治十一年，令蘇利為水軍都督，駐軍碣石，為山東防海之始。乾隆五十五年，以膠州、文登、即墨等營，兼防海口，以總兵駐登州，統水師三營，戰船十二艘，修治各海口砲台。道光二十一年，以芝罘島扼東海之口，撥兵防守。蓬萊、黃縣、榮城、寧海、掖縣、膠州、即墨所屬之十三島，編練民團，互為防衛。三十年，以瀕海之三汛師船，四縣水勇，合併防守海口，並扼要安設大砲。鹹豐元年，登州總兵陳世忠以海寇奪掠官船，山東水師無多，會閩、粵大號師船，合力截捕。三年，於登、萊、青三府舉辦聯莊團練，給以兵械。八年，飭天津鎮總兵赴山東，詳勘海豐一帶海口。九年，以海豐縣之大沽河有防營故址，飭崇恩等撥兵防守。十年，文煜令青州等沿海各城滿、綠營兵，勤加訓練，分守城官兵之半以守海口。同治九年，丁寶楨以東境海口紛歧，惟有扼要防守。其文登縣屬之馬頭石島，福山縣屬之煙台，蓬萊縣屬之廟島，掖縣屬之小石島，為洋船北來所必經，第居險要，共撥兵六千餘人分守。十一年，撥大號兵船一艘，駐泊登州洋面。光緒元年，丁寶楨以山東之東三府，三面環海，外寇隨處可登，宜扼要屯守。其要地有三：一、煙台，於通申岡設防營，駐兵三千。煙台山下及八蠟廟、芝罘島之西，共建浮鐵砲台三座。芝罘島之東，築沙土曲折砲台一座。一、威海衛，於劉公島之東口，建浮鐵砲台一座，而於島口內築沙土曲折砲台，於口外海面密佈水雷，其北口內亦建沙土浮鐵砲台，可作兵輪船水寨之用。一、登州，於城北建沙土高式砲台，城內建沙土圓式砲台。長山之西，建沙土曲折砲台，與郡城相犄角。砲台用克魯伯後膛大砲，參用阿姆司脫朗前膛大砲。兵丁用格林砲、克魯伯四磅砲、亨利馬悌尼快槍，請求行陣攻守之法。六年，以新購外洋蚊砲船駐防煙台海面。十二年，許景澄建議山東膠州灣當南北洋之中，東為浮山，西為靈山，口狹而水深，宜規畫形勢，為新練海軍屯港，與旅順口東西相應。是年，李鴻章於威海衛南北岸築砲台，布水雷。十七年，於威海黃泥岩增築新式砲台，又於南岸龍廟嘴砲台外，增築趙北口砲台。劉公島新築地阱砲台，設後膛巨砲於隧道。其西之黃島，水中之日島，亦設砲台，與南岸相應。劉公島又設大鐵碼頭，為海軍寄椗上煤之所，防務益周密。
東省形勢，以威海、膠州為要口，於海軍屯泊尤宜。乃甲午一役，威海水陸之防，既毀於日本，而德因教案，曾以大隊鐵艦奪踞膠州灣，闢商埠，開鐵路，浸窺腹地。東省海防，遂無所藉手雲。
江南海防，自海州南歷長江、吳淞江二口，稍折而西，至松江奉賢縣境之海灣，南接浙江洋面，其間港口羅列。惟江陰、吳淞二處，一為長江之筦鍵，一為蘇、松之門戶，防務尤重。至江陰以上，以江流深廣，外海兵艦商船，溯流而上，西達夔、渝，三千里流域，雖皖、贛、楚、蜀各有江防，實以江南當下遊之沖。自狼、福山以迄京口、金陵，砲壘防營，星羅棋布。上遊防衛，與下遊繁簡迥殊。而江蘇轄境，長江千里，兵艦砲台，無異海防，水陸營汛，亦與海疆聯絡。故安徽省以上江防，即隷於蘇省海防焉。
自海州南抵江口，乃昔年黃河入海處，泥沙積久，凝結內海，稱五條沙，海潮甚急。海舶北赴燕、齊者，必東行一晝夜以避其沙，故淮、海州郡，得稍寬海防者，以五條沙為之保障也。自狼、福山口南抵吳淞，沙凝潮急，略同北境。惟長江、吳淞二口，水深溜大，巨艦可直駛內江，故海口防務，視海濱倍重。
清初平定江南，分八旗勁旅駐京口，以鎮海大將軍統之，設水師營，造沙唬船以鰼水戰。旋以沙唬船難涉大洋，乃改造鳥船。時鄭成功據台灣，以師船進窺江表，由京口薄金陵，梁化鳳擊敗之。順治十四年，命梁化鳳為水軍都督，率軍萬人，駐防崇明、吳淞。以松江府三面臨海，設提督，駐重兵。康熙六年，因崇明孤懸大海，嚴出海之禁。十四年，以提督統八營駐崇明。二十三年，減存四營，列汛六十有八。太倉州為元代海運放洋之口，明代置兵屯守，清初設遊擊，以劉河營移駐茜涇鎮。雍正四年，分設寶山縣，列汛五十有七。上海縣當黃浦江之沖，原有墩台十七座，康熙二年，以墩台距海較遠，乃建外塘斥堠。其南為金山縣，踞青浦、南匯之上遊，設參將駐守，列汛七十有八。常熟之福山，與隔江之狼山對峙，常熟、昭文瀕海之口，為許浦、徐陸涇、白第港，康熙間，設墩堡戍守，列汛二十有四。通州為狼山營汛地，如皋為掘港營汛地，皆近海要區也。其北境之海州，為南北襟要，海口之大者凡九，最北為荻水口，其東北雲台山，清初曾徙民內地，阻塞入海之道，康熙二十年復開通，設通海營，列汛五十有五。淮安府昔為淮河入海之處，設廟灣、鹽城二營，會哨巡防，列汛四十有二。揚州府北之興化，南之泰州，為濱海之縣，清初設守備，康熙十一年，設遊擊鎮之，列汛凡十。雍正八年，以福山營為江海門戶，於江蘇鎮標四營內分兵船二艘隷之，與狼山營會哨。此清初至雍正年江南之海防也。
乾隆至道光，江海清平，防汛率循舊制。及道光中葉，海警驟起，東南戒嚴。二十一年，以寶山海口為江南要區，屯駐大營，分設遊緝之兵。吳淞亦屯兵，增設濠壘。二十二年，令耆英等周歷吳淞、狼山、福山、圌山關各處，整頓戰船砲械。二十三年，以江陰鵝鼻嘴為由海入江要口，設險守禦。又防堵瓜洲及南河、灌河、射陽湖之口。令璧昌等察沿海城邑，聯絡保障。所用砲位，設局開鑄，並造水師舢板船，築砲台於江岸南北。二十四年，璧昌因狼、福山江面太寬，於劉聞沙、東生洲、順江洲、沙圩等處，修築砲堤。水師各營，增大小戰船一百三十餘艘，分廠製造。二十七年，李星沅籌防泖湖，貯石沈船，增置木牌，並存儲砲位，分佈重兵。而其時所築砲台，實止因土為堤，且器械窳舊，佈置多疏，非特不足禦歐洲巨艦，鹹豐間，粵寇東下，沿江防戍，鹹望風奔靡。及湘軍底定東南，軍勢始振。
同治元年，諭薛煥等購西洋兵艦，在上海等要口防守。四年，曾國籓於狼山鎮標，每營增造大舢板船二十號，仿紅單船之式，多設砲位，巡緝內洋。海門設綏海營，置大舢板船二十號，酌設兵輪，分防北岸海汊。七年，更定內洋水師五營，外洋水師六營之制。以兵輪四艘，分隷蘇松、狼山、福山三鎮總兵，駐防海口。九年，南洋初設兵輪統領，駕駛出洋，周歷島嶼。十三年，調陝防武毅軍馬步二十二營，赴山東、江南沿海適中之地駐防日本。時台灣告警，李宗羲以蘇、松之門戶，吳淞為要，長江之關鍵，江陰為先，而鎮江府屬之焦山、象山，對岸之天都廟，江寧府屬之烏龍山，省城外之下關，均為扼要。以大木方石為基，搗三合土，築砲台砲門，護以鐵柱鐵板，空其下以藏砲兵。先築烏龍山砲台十六座，以次江陰、天都廟、象山、焦山、下關各築明暗砲台，置巨砲。北岸之沙州圩、吳淞口，及江陰北岸之劉聞沙，亦一律增建砲台，以嚴防務。
