夏四月戊戌，以綽克托為烏什參贊大臣。庚戌，命索琳以署禮部侍郎在軍機處行走。辛亥，命慶桂以理籓院侍郎、副都統為伊犁參贊大臣。丙辰，諭高晉賑清河等州縣及大河、長淮二衛被水災民。戊午，加大學士溫福、戶部尚書舒赫德、工部尚書福隆安太子太保，禮部尚書王際華、工部尚書裘曰修太子少傅，禮部尚書阿桂、署兵部尚書豐升額、直隷總督周元理、閩浙總督鍾音、四川總督劉秉恬太子少保。
五月辛酉，工部尚書裘曰修卒，以嵇璜代之。丙寅，上奉皇太後啟鑾，免經過地方本年錢糧十分之三。壬申，上奉皇太後駐蹕避暑山莊。乙亥，盛京將軍增海卒，調弘晌代之。丁醜，改烏魯木齊參贊大臣為都統，以索諾木策淩為之，仍聽伊犁將軍節制。己卯，猛遮土目叭立齋等內附。癸未，召車布登紮布來京，命拉旺多爾濟署烏里雅蘇台將軍。乙巳，阿桂等奏金川番賊陷喇嘛寺糧台，襲據底木達、布朗郭宗。己酉，鄂寶奏金川番賊襲據大板昭。壬子，定邊將軍溫福、四川提督馬全、署貴州提督牛天畀敗績於木果木，俱死之。癸醜，以阿桂為定邊將軍，贈溫福一等伯。小金川酋僧格桑父澤旺伏誅。大學士劉綸卒。甲寅，以富勒渾為四川總督，起文綬為湖廣總督。丙辰，阿桂奏剿洗小金川番賊，盡毀碉寨，諭嘉之。
秋七月戊午朔，召舒赫德來京，以伊勒圖為伊犁將軍，慶桂為塔爾巴哈台參贊大臣。己未，金川番賊陷美諾、明郭宗，海蘭察退師日隆。諭阿桂由章穀退師，豐升額退駐巴拉朗等處。癸亥，命富德為參贊大臣赴軍營，命阿桂撤噶爾拉之師。甲子，命舒赫德為武英殿大學士。調阿桂為戶部尚書，永貴為禮部尚書。丙寅，齊齊哈爾蝗。丁卯，以溫福乖方僨事，革一等伯爵，仍予恤典。褫劉秉恬職。命議恤木果木陣亡提督馬全、牛天畀，副都統巴朗、阿爾素納，總兵張大經及各文武員弁。丙戌，諭阿桂先復小金川，分三路進剿。
八月戊子，以阿桂為定西將軍。命於敏中為文華殿大學士，舒赫德管刑部，劉統勛專管吏部。己醜，命程景伊協辦大學士。調王際華為戶部尚書，蔡新為禮部尚書，嵇璜為兵部尚書。以閻循琦為工部尚書。戊戌，以明亮為定邊右副將軍，富德為參贊大臣。壬寅，上幸木蘭行圍。
九月壬戌，降海蘭察為領隊大臣。甲子，上回駐避暑山莊。戊辰，上送皇太後迴鑾。己巳，索諾木挾僧格桑歸大金川，以其兄岡達克往美諾。諭阿桂乘機收復。允戶部請開金川軍需捐例。壬申，上自避暑山莊迴鑾。甲戌，以多敏為科布多參贊大臣，車木楚克紮布為烏里雅蘇台參贊大臣。戊寅，上奉皇太後還京。庚辰，吏部尚書託庸致仕，調官保為吏部尚書。以英廉為刑部尚書，仍兼管戶部侍郎事。
冬十月乙巳，和碩諴親王允祕卒。己酉，褫車布登紮布定邊左副將軍職，仍留親王銜，以瑚圖靈阿代之。
十一月丁卯，阿桂等奏進剿小金川，攻克資哩山梁等處，收復沃克什官寨。戊辰，命福祿往西寧辦事。召伍彌泰回京。己巳，阿桂等奏克複美諾，命進剿金川。辛未，軍機大臣、大學士劉統勛卒，上親臨賜奠，贈太傅。壬申，召梁國治來京，在軍機處行走。調巴延三為湖南巡撫。以畢沅為陝西巡撫。癸酉，明亮等奏克複僧格宗等碉寨。
十二月癸巳，以彰寶為雲貴總督。辛醜，命李侍堯為武英殿大學士，仍管兩廣總督事。
是歲，朝鮮、安南來貢。
三十九年春正月丙子，以姚立德為河東河道總督。丁醜，阿桂等克贊巴拉克等山梁。
二月甲申朔，命豐升額等助阿桂進攻勒烏圍。丁亥，明亮等奏克木谿等山梁。戊戌，豐升額等克莫爾敏山梁。乙巳，蠲江蘇山陽等十州縣衛三十八年水災額賦有差。丁未，上詣東陵，並巡幸盤山。庚戌，謁昭西陵、孝陵、孝東陵、景陵，至孝賢皇後陵奠酒。臨故大學士公傅恆塋賜奠。辛亥，上駐蹕盤山。
三月庚申，阿桂等克羅博瓦山梁，加阿桂太子太保，以海蘭察為內大臣，額森特為散秩大臣。甲子，上幸南苑行圍。辛未，阿桂等克得斯東寨。庚辰，明亮等克喀咱普等處，上嘉賚之。
夏四月乙酉，順天大興等州縣蝗。辛亥，以京師及近畿地方旱，命刑部清理庶獄，減軍流以下罪，直隷如之。戊戌，以禦史李漱芳劾福隆安家人滋事，上嘉之，予敘。
五月癸醜朔，命刑部減秋審、朝審緩決一二次以上罪。丙寅，彰寶以病解任，以圖思德署雲貴總督。戊辰，上奉皇太後秋獮木蘭。甲戌，上奉皇太後駐蹕避暑山莊。
六月癸卯，阿桂等奏克穆爾渾圖碉卡。
秋七月甲寅，阿桂等克色淜普山碉卡。己未，阿桂等克喇穆喇穆山等碉卡。壬戌，阿桂等剋日則雅口等處寺碉。乙醜，烏魯木齊額魯特部蝗。庚午，明亮等克達爾圖山梁碉卡。甲戌，以於敏中未奏太監高雲從囑託公事，下部嚴議。以阿思哈為左都禦史。乙亥，命阿思哈在軍機處行走。太監高雲從處斬。辛巳，阿桂等克格魯瓦覺等處碉寨。
八月壬午朔，日食。壬辰，富德等克穆當噶爾、羊圈等處碉卡。丁酉，上幸木蘭行圍。癸卯，金川頭人綽窩斯甲降，獻賊目僧格桑屍。
九月乙卯，山東壽張縣奸民王倫等謀逆，命山東巡撫徐績剿捕之。丁巳，命大學士舒赫德赴江南，同高晉塞決口。戊午，上回駐避暑山莊。命舒赫德先赴山東剿捕王倫。庚申，命額駙拉旺多爾濟、左都禦史阿思哈帶侍衛章京及健鋭、火器二營兵，往山東會剿王倫。辛酉，王倫圍臨清，屯閘口。壬戌，上送皇太後迴鑾。癸亥，以天津府七縣旱，命撥通倉米十萬石備賑。丙寅，上自避暑山莊迴鑾。丁卯，山東兗州鎮總兵惟一、德州城守尉格圖肯以臨陣退避，處斬。庚午，以江蘇山陽等四縣水災，命免明年額賦。壬申，上奉皇太後還京師。丙子，山東臨清賊平，王倫自焚死。
冬十月辛巳朔，以楊景素為山東巡撫。壬辰，免臨清新城本年未完額賦，並舊城未完額賦十分之五。丙午，以徐績為河南巡撫。
十一月癸醜，明亮等剋日旁等碉寨。甲寅，以舒赫德為禦前大臣。阿桂等剋日爾巴當噶碉寨。以阿桂為禦前大臣，海蘭察為禦前侍衛。丙辰，以四川成都等一百四十府州縣行軍運糧，免歷年額賦有差。戊辰，阿桂克格魯古丫口等處碉寨。
是歲，朝鮮、琉球來貢。
四十年春正月甲戌，阿桂等克康爾薩山梁。
二月己卯，阿桂等克甲爾納等處碉寨。丙戌，阿桂克斯莫思達碉寨。癸巳，以李瀚為雲南巡撫。
三月辛亥，上幸盤山。甲寅，上駐蹕盤山。蠲江南句容等十九州縣，淮安、大河二衛三十九年水旱災額賦。壬申，蠲長蘆屬滄州等六州縣、嚴鎮等六場，河南信陽等五州縣三十五年旱災額賦。
夏四月戊寅朔，蠲安徽合肥等十四州縣、廬州等四衛三十九年旱災額賦。丙戌，四川軍營參贊大臣、領侍衛內大臣、和碩親王、固倫額駙色布騰巴勒珠爾卒。己醜，命明山為烏里雅蘇台參贊大臣。壬寅，賜吳錫齡等一百五十八人進士及第出身有差。癸卯，阿桂等克木思工噶克丫口等處城碉。明亮等克甲索、宜喜。乙巳，明亮等克達爾圖等處碉寨。以明亮、福康安為內大臣。
五月己酉，蠲直隷霸州、保定等三十九州縣三十九年旱災額賦。甲寅，阿桂等奏克巴木通等處碉卡。丁巳，明亮奏克茹寨、甲索等處碉卡。戊辰，阿桂等奏克噶爾丹等碉寨。壬申，上幸木蘭，奉皇太後駐湯山行宮。明亮等奏克巴舍什等處碉寨。乙亥，阿桂等奏克遜克爾宗等處碉寨。加封定邊右副將軍、果毅公豐升額為果毅繼勇公。
六月丁醜朔，蠲湖北漢陽等十五州縣、武昌等六衛一所三十九年旱災額賦。戊寅，上駐避暑山莊。癸未，上詣廣仁嶺萬壽亭迎皇太後駐蹕避暑山莊。壬辰，以豐升額為兵部尚書。丙申，領隊大臣額爾特褫職逮治。庚子，設管理烏魯木齊額魯特部落領隊大臣，以全簡為之。
秋七月壬戌，阿桂等奏攻克昆色爾等處山梁碉寨。丁卯，阿桂等克章噶等碉寨。額洛木寨頭人革什甲木參等率眾來降。庚午，蠲甘肅皋蘭等七州縣三十九年被水被旱額賦。阿桂等克直古腦一帶碉寨。
