是年，朝鮮，喀爾喀部畢席勒爾圖汗、冰圖台吉、額爾德尼韋徵諾顏、吳巴什諾顏、土謝圖汗下完書克諾顏，厄魯特部敖齊爾圖台吉子伊拉古克三、班第大胡土克圖、綽克圖台吉、巴圖魯台吉、達賴烏巴什台吉，索倫部馬魯喀、虎爾格吳爾達爾漢，東夷託科羅氏、南迪歐，達賴喇嘛、班禪胡土克圖均來貢。朝鮮三至。
十五年春正月庚子，大赦。詔曰：「帝王孝治天下，禮莫大乎事親。比者皇太後聖躬違和，朕夙夜憂懼。賴荷天眷，今已大安。遘茲大慶，宜沛殊恩。其自王公以下，中外臣僚，並加恩賚。直省逋賦，悉與豁免。吏民一切詿誤，鹹赦除之。」壬寅，停祭堂子。以多羅信郡王多尼為安遠靖寇大將軍，率師征雲南。戊午，祀圜丘，己未，祀方澤，辛酉，祀太廟社稷，以太後疾愈故。皇第四子薨。丙寅，以周召南為延綏巡撫。
二月甲戌，賑畿輔。甲申，免武清、漷上年災賦。己醜，減遼陽稅額。辛卯，川東賊帥張京等來降。甲午，命部院官各條陳事宜。乙未，禦經筵。
三月辛醜，李定國黨閆維龍等陷橫州，官軍擊走之。甲辰，內監吳良輔以受賄伏誅。壬子，免襄陽、鄖陽荒賦。戊午，追封科爾沁巴圖魯王女為悼妃。甲子，追封皇第四子為和碩榮親王。
夏四月辛未，賜孫承恩等進士及第出身有差。丙子，官軍敗賊於合州，克重慶。癸未，免江夏等七縣十三年災賦。丙戌，較射於景山。辛卯，免淳化荒賦。大學士王永吉以罪免。壬辰，大學士陳之遴復以罪流盛京。
五月丁酉朔，日有食之。癸卯，調衛周祚為吏部尚書。戊申，以劉昌為工部尚書。更定銓選法。辛亥，鄭成功將犯澄海，遊擊劉進忠以城叛，降於成功。壬子，免山東十一年以前灶丁逋課。己未，較射於景山。辛酉，裁詹事府官。壬戌，廣西賊將賀九儀犯賓州，官兵擊敗之。癸亥，以胡世安、衛周祚、李霨為內院大學士。甲子，官軍復沅靖，進取貴陽、平越、鎮遠等府，南丹、那地、獨山等州，撫寧土司俱降。
六月戊辰，吳三桂等敗李定國將劉正國於三坡，克遵義，拔開州。辛未，以趙廷臣為貴州巡撫。壬申，以佟國器為浙江巡撫，蘇弘祖為南贛巡撫。丙子，官軍敗海寇於白沙。辛巳，以李棲鳳為兩廣總督。甲申，以王崇簡為禮部尚書。壬辰，免靖、沅陵等十五州縣及平溪九衛所額賦。癸巳，鄭成功犯溫州，陷平陽、瑞安。
秋七月己亥，裁宣大總督。己酉，以潘朝選為保定巡撫。庚戌，沙爾虎達擊羅剎，敗之。改內三院大學士為殿閣大學士。設翰林院及掌院學士官。增各道禦史三十人。己未，免桂陽、衡陽等十州縣上年災賦。甲子，以巴哈、費揚古、郭邁、屠祿會、馬爾濟哈、鄂莫克圖、坤巴圖魯、鄔布格德墨爾根袍、喀蘭圖、鄂塞、博洛塞冷、巴特瑪、巴泰俱為內大臣，趙國祚為浙江總督，李率泰專督福建。
八月癸酉，以李顯貴為鑲白旗漢軍固山額真。丙子，敕諭多尼等，授以方略。李定國將王興及水西宣慰使安坤等來降。癸巳，禦經筵。
九月丁酉，以孫塔為鑲藍旗蒙古固山額真。庚戌，更定理籓院大闢條例。己酉，以能圖為左都禦史。壬子，賜鑲黃、正黃、正白三旗官校金。甲寅，改內院大學士覺羅巴哈納、金之俊為中和殿大學士，額色黑、成克鞏為保和殿大學士，蔣赫德、劉正宗為文華殿大學士，洪承疇、傅以漸、胡世安為武英殿大學士，衛周祚為文淵閣大學士，李霨為東閣大學士。己未，免福州、興化、建寧三府，福寧州十二、十三兩年荒賦。癸亥，發帑賜出征軍士家。
冬十月壬午，以祖重光為順天巡撫。荊州、襄陽、安陸霪雨，江溢，漂沒萬餘人。
十一月甲午朔，海寇犯洛陽內港，官軍擊敗之。乙未，免鄖陽、襄陽荒賦。庚子，定宮中女官員額品級。辛醜，免林縣災賦十之三。江南考官方猶、錢開宗等坐納賄棄市。
十二月壬申，以索渾為鑲白旗滿洲固山額真。甲戌，免五台災賦。壬午，故明宗室硃議滃率眾降。乙酉，以鄔赫為禮部尚書。免山陰等八縣上年災賦。戊子，以明安達禮為安南將軍，率師駐防貴州。己醜，諭曰：「川、湖、雲、貴之人，皆朕臣庶，寇亂以來，久罹湯火。今大軍所至，有來歸者，加意拊循，令其得所。能效力建功者，不靳爵賞。」
是年，朝鮮，喀爾喀部竇爾格齊諾顏、噶爾當台吉、土謝圖汗、畢席勒爾圖汗、丹津喇嘛，厄魯特部阿巴賴諾顏，車臣台吉下車臣俄木布、鄂齊爾圖台吉，索倫部達把代，庫爾喀部塔爾善，使犬國頭目替爾庫，達賴喇嘛俱來貢。朝鮮、喀爾喀土謝圖汗、厄魯特阿巴賴諾顏再至。
十六年春正月甲午，桂王將譚文犯重慶，其弟譚詣殺之，及譚弘等來降。丁酉，以徐永正為福建巡撫。庚子，多尼克雲南，以捷聞。初，多尼、吳三桂、趙布泰會師於平越府之楊老堡，分三路取雲南。多尼自貴陽入，渡盤江至松嶺衛，與白文選遇，大敗之。三桂自遵義至七星關，不得進，乃由水西間道趨烏撒。趙布泰自都勻至盤江之羅顏渡，敗守將李成爵於山穀口，又敗李定國於雙河口，所向皆捷，遂俱抵雲南，入省城。李定國、白文選奉桂王奔永昌。癸卯，以林天擎為雲南巡撫。甲辰，以巴海為昂邦章京，駐防寧古塔。辛亥，賜外籓蒙古諸王貧乏者馬牛羊。癸醜，以趙廷臣為雲貴總督，卞三元為貴州巡撫。
二月丙寅，免潼關衛辛莊等屯上年災賦。丁卯，海寇犯溫州，官軍擊敗之。庚午，以雲、貴蕩平，命今秋舉會試。辛未，免荊州、潛江等九州縣及沔陽、安陸二衛上年災賦。丙子，命羅託等班師，明安達禮駐防荊州。壬午，以許文秀為山東巡撫。
三月丙申，以蔣國柱為江寧巡撫。己亥，以張仲第為延綏巡撫。戊申，以硃衣助為安徽巡撫。鄭成功犯浙江太平縣，官軍擊敗之。己酉，禦經筵。甲寅，命吳三桂鎮雲南，尚可喜鎮廣東，耿繼茂鎮四川。丁巳，免襄陽等六縣災賦。
閏三月壬戌，大學士胡世安以疾解任。丁卯，定犯臓例，滿十兩者流席北，應杖責者不准折贖。甲申，免鍾祥縣上年災賦。圖海有罪，免。丙戌，封譚弘為慕義侯，譚詣為鄉化侯。丁亥，以張自德為陝西巡撫。
夏四月甲寅，多尼、吳三桂軍克鎮南州，白文選縱火燒瀾滄江鐵橋遁走。我軍進克永昌，李定國奉桂王走騰越，伏兵於磨盤山，我軍力戰，復克騰越。
五月壬戌，廣西南寧、太平、思恩諸府平。己巳，以劉秉政為寧夏巡撫。晉封滿硃習禮為和碩達爾漢巴圖魯親王。戊寅，官軍擊成功於定關，敗之，斬獲甚眾。辛巳，發內帑銀三十萬兩，以其半賑雲、貴窮黎，其半給徵兵餉。
六月庚子，朝鮮國王李淏薨。壬子，鄭成功陷鎮江府。
秋七月丁卯，以達素為安南將軍，同索洪、賴塔等率師征鄭成功。丙子，鄭成功犯江寧。庚辰，幸南苑。甲申，還宮。
八月己醜朔，江南官軍破鄭成功於高山，擒提督甘煇等，燒敵船五百餘艘。成功敗遁，我軍追至瓜州，敵兵大潰。先是，成功擁師十餘萬，戰艦數千，抵江寧城外，列八十三營，絡繹不絶，設大砲、地雷、雲梯、木柵，為久困之計，軍容甚盛。我軍噶褚哈、馬爾賽等自荊州以舟師來援，會蘇松水師總兵官梁化鳳及遊擊徐登第、參將張國俊等各以軍至，總督郎廷佐合軍會戰，水陸併進，遂以捷聞。庚寅，禦經筵。癸巳，幸南苑。以劉之源為鎮海大將軍，同梅勒章京張元勛等駐防鎮江。以蔡士英為鳳陽巡撫，總督漕運；宜永貴為安徽巡撫，提督操江。丙申，安南國都將武公恣遣使納款於洪承疇軍前。戊戌，還宮。甲辰，鄭成功復犯崇明，官軍擊敗之。乙巳，幸南苑。丙午，還宮。
九月庚申，免台州四年至十年被寇稅賦。乙亥，賜陸元文等進士及第出身有差。丁醜，以杜立德為刑部尚書。戊寅，予故朝鮮國王李淏謚，封世子■B
3為國王。庚辰，以海爾圖為鑲藍旗漢軍固山額真。辛巳，尊興京祖陵為永陵。甲申，幸南苑。
冬十月庚戌，洪承疇以疾解經略任。甲寅，奈曼部達爾漢郡王阿漢以罪削爵為庶人。
