虎賁親軍都指揮使司，秩正三品，管領上都路元籍軍人，兼奧魯之事。至元十六年，立虎賁軍，設官二員。十七年，置都指揮使二員、副都指揮使一員，又增置副都指揮使一員。元貞元年，以虎賁軍改為虎賁親軍都指揮使司。十一年，增置都指揮使六員。至大四年，省都指揮使九員。後定置司官，都指揮使三員，正三品；副都指揮使二員，從三品；僉事二員，正四品；經歷一員，從七品；知事、照磨兼承發各一員，並從八品；令史七人，譯史、通事、知印各一人，典吏二人，鎮撫二員，都目一員。
撒的赤千戶翼，正達魯花赤一員，副達魯花赤一員，正千戶一員，副千戶一員，知事一員，百戶二十員，彈壓二員。
不花千戶翼，正達魯花赤一員，副達魯花赤一員，正千戶一員，副千戶一員，百戶二十二員，彈壓二員。
脫脫木千戶翼，正達魯花赤一員，副達魯花赤一員，正千戶一員，副千戶一員，知事一員，百戶二十八員，彈壓二員。
大忽都魯千戶翼，正達魯花赤一員，副達魯花赤一員，正千戶一員，副千戶一員，知事一員，百戶二十四員，彈壓二員。
楊千戶翼，正達魯花赤一員，副達魯花赤一員，正千戶一員，副千戶一員，知事一員，百戶二十二員，彈壓二員。
迷裡火者千戶翼，正達魯花赤一員，副達魯花赤一員，正千戶一員，副千戶一員，知事一員，百戶二十員，彈壓二員。
大都督府，正二品，管領左右欽察兩衛、龍翊侍衛、東路蒙古軍元帥府、東路蒙古軍萬戶府、哈剌魯萬戶府。天歷二年，始立欽察親軍都督府，秩從二品。後改大都督府。置大都督三員，正二品；同知二員，正三品；副都督三員，從三品；僉都督事二員，正四品；經歷二員，從六品；都事二員，從七品；管勾一員，照磨一員，俱正八品；令史八人，蒙古必闍赤二人，怯裡馬赤二人，知印二人，宣使六人。
右欽察衛，秩正三品。至元二十三年，依河西等衛例，立欽察衛，設官十員。至治二年，分為左右衛。天歷二年，撥隷大都督府。定置達魯花赤一員，正三品；都指揮二員，正三品；副使二員，從三品；僉事二員，正四品；經歷二員，從七品；知事二員，照磨二員，並從八品；令史七人，譯史、通事、知印各一人，鎮撫一員。
行軍千戶十八所，達魯花赤各一員，千戶三十六員，百戶一百八十員，彈壓一十八員。
屯田千戶所二，達魯花赤二員，千戶二員，百戶二十員，彈壓二員。
門尉二員。
儒學教授一員，至大四年始置；蒙古字教授一員，延祐四年始置。
左欽察衛，秩正三品。至治二年，依阿速衛例，分為兩衛，設官十員。天歷二年，撥隷大都督府。定置衛官，都指揮使三員，正三品；副都指揮二員，從三品；僉事二員，正四品；經歷二員，從七品；知事二員，照磨一員，從八品；令史七人，譯史、通事、知印各一人，屬官鎮撫二員。
行軍千戶所一十翼，千戶一十員，百戶八十二員，彈壓九員，奧魯官四員。
守城千戶所一翼，達魯花赤一員，千戶一員，百戶九員，彈壓一員。
屯田千戶所一翼，達魯花赤一員，千戶一員，百戶十員，彈壓一員。
教官，儒學教授一員。
龍翊侍衛親軍都指揮使司，秩正三品。天歷元年始立，設官十四員。二年，又置愛馬知事一員，又以左欽察衛唐吉失九千戶隷本衛。定置官，都指揮使三員，正三品；副都指揮使二員，從三品；僉事二員，正四品；經歷一員，從七品；知事二員，照磨一員，並從八品；令史七人，譯史二人，怯裡馬赤二人，知印二人，鎮撫二員。
行軍千戶所九翼，達魯花赤一員，千戶六員，副千戶一員，百戶四十五員，彈壓五員。
屯田一翼欽察千戶所，達魯花赤一員，千戶一員，百戶二十二員，彈壓二員。
教官二，蒙古字教授一員，儒學教授一員。
哈剌魯萬戶府，掌守禁門等處應直宿衛。至元二十四年，招集哈剌魯軍人，立萬戶府。尋移屯襄陽，後征交趾。大德二年置司南陽。天歷二年，奏隷大都督府。定置官，達魯花赤一員，萬戶一員，經歷、知事各一員，提控案牘一員，鎮撫一員，吏目一員。
千戶所三翼，千戶三員，百戶九員，彈壓三員。
御史台，秩從一品。大夫二員，從一品；中丞二員，正二品；侍御史二員，從二品；治書侍御史二員，正三品，掌糾察百官善惡、政治得失。至元五年，始立台建官，設官七員。大夫從二品，中丞從三品，侍御史從五品，治書侍御史從六品，典事從七品，檢法二員，獄丞一員。七年，改典事為都事。十九年，罷檢法、獄丞。二十一年，升大夫為從一品，中丞為正三品，侍御史為正五品，治書為正六品。二十七年，大夫以下品從各升一等，始置蒙古經歷一員。大德十一年，升中丞為正二品，侍御史為從二品，治書侍御史為正三品。皇慶元年，增中丞為三員。二年，減一員。至治二年，大夫一員。後定置御史大夫二員、中丞二員、侍御史二員、治書侍御史二員，品秩如上；經歷一員，從五品；都事二員，正七品；照磨一員，正八品；承發管勾兼獄丞一員，正八品；架閣庫管勾兼承發一員，正九品；掾史一十五人，譯史四人，知印二人，通事二人，宣使十人，台醫二人，蒙古書寫二人，典吏六人，庫子二人。其屬有二：
殿中司，殿中侍御史二員，正四品。至元五年始置，秩正七品，後升正四品。凡大朝會，百官班序，其失儀失列，則糾罰之；在京百官到任假告事故，出三日不報者，則糾舉之；大臣入內奏事，則隨以入，凡不可與聞之人，則糾避之。知班四人，通事、譯史各一人。
察院，秩正七品，監察御史三十二員，司耳目之寄，任刺舉之事。至元五年，始置御史十一員，悉以漢人為之。八年，增置六員。十九年，增置一十六員，始參用蒙古人為之。至元二十二年，參用南儒二人。書吏三十二人。
江南諸道行御史台，設官品秩同內台。至元十四年，始置江南行御史台于楊州，尋徙杭州，又徙江州。二十三年，遷于建康，以監臨東南諸省，統制各道憲司，而總諸內台。初置大夫、中丞、侍御史、治書侍御史各一員，統淮東、淮西、湖北、浙東、浙西、江東、江西、湖南八道提刑按察司。十五年，增江南湖北、嶺南廣西、福建廣東三道。二十三年，以淮東、淮西、山南三道，撥隷內台。三十年，增海北海南一道。大德元年，定為江南諸道行御史台，設官九員，以監江浙、江西、湖廣三省，統江東、江西、浙東、浙西、湖南、湖北、廣東、廣西、福建、海南十道。大夫一員，中丞二員，侍御史二員，治書侍御史二員，經歷一員，都事二員，照磨一員，架閣庫管勾一員，承發管勾兼獄丞一員，令史一十六人，譯史四人，回回掾史、通事、知印各二人，宣使十人，典吏、庫子、台醫各有差。
察院，品秩如內察院。至元十四年，置監察御史十員，書吏十員。二十三年，增蒙古御史十四員、書吏十四人，又增漢人御史四員、書吏四人。後定置御史二十八員、書吏二十八人。
