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自然選擇是否真能如此發生作用，使各種生物類型適應于它們的若干條件和生活處所，必鬚根據以下各章所舉的證據來判斷。但是我們已經看到自然選擇怎樣引起生物的絶滅；而在世界史上絶滅的作用是何等巨大，地質學已明白他說明了這一點。自然選擇還能引致性狀的分歧；因為生物的構造、習性及體質愈分歧；則這個地區所能維持的生物就愈多，——我們只要對任何一處小地方的生物以及外地歸化的生物加以考察，便可以證明這一點。所以，在任何一個物種的後代的變異過程中，以及在一切物種增加個體數目的不斷鬥爭中，後代如果變得愈分歧，它們在生活鬥爭中就愈有成功的好機會，這樣，同一物種中不同變種間的微小差異，就有逐漸增大的傾向，一直增大為同屬的物種間的較大差異、或者甚至增大為異屬間的較大差異。
我們已經看到，變異最大的，在每一個綱中是大屬的那些普通的、廣為分散的、以及分佈範圍廣的物種；而且這些物種有把它們的優越性——現今在本上成為優勢種的那種優越性——傳給變化了的後代的傾向。正如方纔所講的，自然選擇能引致性狀的分歧，並且能使改進較少的和中間類型的生物大量絶滅。根據這些原理，我們就可以解釋全世界各綱中無數生物問的親緣關係以及普遍存在的明顯區別。這的確是奇異的事情，——只因為看慣了就把它的奇異性忽視了——即一切時間和空間內的一切動物和植物，都可分為各群，而彼此關聯，正如我們到處所看到的情形那樣，——即同種的變種問的關係最密切，同屬的物種問的關係較疏遠而且不均等，乃形成區（section）及亞屬；異屬的物種間關係更疏遠，並且屬間關係遠近程度不同，乃形成亞科、科、目、亞綱及綱。
任何一個綱中的幾個次級類群都不能列入單一行列，然皆環繞數點，這些點又環繞着另外一些點，如此下去，几乎是無窮的環狀組成。如果物種是獨立創造的，這樣的分類便不能得到解釋；但是，根據遺傳，以及根據引起絶滅和性狀分歧的自然選擇的複雜作用，如我們在圖表中所見到的，這一點便可以得到解釋。
同一綱中一切生物的親緣關係常常用一株大樹來表示。我相信這種比擬在很大程度上表達了真實情況。綠色的、生芽的小枝可以代表現存的物種；以往年代生長出來的枝條可以代表長期的、連續的絶滅物種。在每一生長期中，一切生長着的小枝都試圖向各方分枝，並且試圖遮蓋和弄死周圍的新技和枝條，同樣地物種和物種的群在巨大的生活鬥爭中，隨時都在壓倒其他物種。
巨枝為分大枝，再逐步分為愈來愈小的枝，當樹幼小時，它們都曾一度是生芽的小枝；這種舊芽和新芽由分枝來連結的情形，很可以代表一切絶滅物種和現存物種的分類，它們在群之下又分為群。當這樹還僅僅是一株矮樹時，在許多茂盛的小枝中，只有兩三個小枝現在成長為大枝了，生存至今，並且負荷着其他枝條；生存在久遠地質時代中的物種也是這樣，它們當中只有很少數遺下現存的變異了的後代，從這樹開始生長以來，許多巨枝和大枝都已經枯萎而且脫落了；這些枯落了的、大小下等的枝條，可以代表那些沒有留下生存的後代而僅處于化石狀態的全目、全科及全屬。正如我們在這裡或那裡看到的，一個細小的、孤立的枝條從樹的下部分叉處生出來，並且由於某種有利的機會，至今還在旺盛地生長着，正如有時我們看到如鴨嘴獸或肺魚之類的動物，它們由親緣關係把生物的兩條大枝聯絡起來，並由於生活在有庇護的地點，乃從致命的競爭、裡得到倖免。芽由於生長而生出新芽，這些新芽如果健壯，就會分、出枝條遮蓋四周許多較弱枝條，所以我相信，這巨大的「生命之樹」（TreeofLife）在其傳代中也是這樣，這株大材用它的枯落的枝條填充了地殼，並且用它的分生不息的美麗的枝條遮蓋了地面。
第五章 變異的法則
改變了的外界條件的效果——與自然選擇相結合的使用和不使用；飛翔器官和視覺器官——氣候馴化——相關變異——生長的補償和節約——假相關——重複的、殘跡的及低等體制的構造易生變異——發育異常的部分易於高度變異：物種的性狀比屬的性狀更易變異：次級性徵易生變異——同屬的物種以類似的方式發生變異——長久亡失的性狀的重現——提要。
我以前有時把變異——在家養狀況下的生物裡是如此普遍而且多樣，在自然狀況下的生物裡其程度梢為差些——說得好像是由於偶然而發生的。當然這是一種完全不正確的說法，但是它足以表明我們對於各種特殊變異的原因的無知無識。某些作家相信，產生個體差異或構造的輕微偏差，就像使孩子像他的雙親那樣，是生殖系統的機能。但是變異和畸形，在家養狀況下比在自然狀況下更常發生，並且分佈廣的物種的變異性，比分佈狹的物種為大，這些事實便引導出一個結論，即變異性一般是與生活條件相關聯的，而各個物種已經在這樣的生活條件下生活了若干世代。
