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近代歐洲哲學無論是經驗派還是理性派，直到康德和黑格爾，也都各自從亞里士多德的哲學中吸取了對他們有用的東西。伯內斯把亞里士多德說成是「一切有知識人的老師」，雖然誇張了一點，人們卻可接受。
亞里士多德去世後，他的學生泰奧弗拉斯特繼承了他的事業，呂克昂學園繼續是希臘科學和哲學的中心。但不久，他的著作輾轉流失，被藏於地窖沉睡百餘年。亞里士多德的光輝黯淡了，但科學是不會被埋沒的。公元前
1世紀，亞里士多德的著作被呂克昂第
11任主持人安德羅尼珂重新編輯，從此流傳于世，一大批學者進行註釋、研究。
雖然又被教會禁止過，不過後來又由教會宣揚過，而且是過分的宣揚。公元
12世紀，其著作再次由東方傳入西方，「亞里士多德的思想最後由二條不同的路線轉移到西方。第一條，一小部分邏輯作品由拉丁文之翻譯、評論及鮑耶修斯
波埃修之解述而為大家所熟知。這些就是亞里士多德著作在由第
7世紀至第
12世紀中保留下來的全部。
另一方面，在君士坦丁堡，亞里士多德之著作絶大部分由一條更迂迴的路徑，先傳到敘利亞，然後①經阿拉伯才再回到西方。」 各種抄本廣為流傳，爭相誦讀。
亞里士多德被認為是最有權威性的哲學家，他的思想滲透到一切領域。由於亞里士多德的思想是通過「拉丁阿威羅伊主義」傳入歐洲的，而阿威羅伊側重亞里士多德思想中的唯物主義因素，因而被教會視為異端學說，加以禁止。
1209年巴黎宗教會議作出決定：「任何人不得轉錄、閲讀或以某種形式保存亞里士多德的著作，違者革除教籍。」但教會的禁止未能否定亞里士多德的思想，教會也發現他的思想有可利用之處，所以在後來又規定：從
1366年起，包括羅馬教皇的使節、紅衣主教等僧侶，都必須精讀經教會解釋過的亞里士多德著作，否則，不能得到優等學位。
巴黎文教法甚至規定，除聖經外，一切知識均以亞里士多德的書籍為準，他的著作在學校成了僅次於聖經的絶對權威。“
13世紀中葉，亞里士多德更獲得整個知識界高超的優越地位。大學中，他的學說是以七項人文學代替傳統的教育——文法、邏輯、修辭學、音樂、幾何、算 ① 喬納遜·伯內斯：《亞里士多德》，中國社會科學出版社，
1989年版，第
171頁。
① G.羅伊德《亞里士多德思想的成長與結構》，
台灣聯經出版事業公司，第
201頁。
術及天文學——更常常成為藝術課程之主要部分。如
1225年巴黎學校人文課程的主要用書就包括《邏輯》、大部分之物理學論述、《天界論》《生滅論》《靈魂論》、大部分之《自然學說》及一些生物學論述，甚至《形而上學》及《倫理學》等。到了聖多瑪斯本身更達到了亞里士多德影響力之最高峰，阿拉伯哲學家們曾企圖表示亞里士多德形而上學如何能與伊斯蘭教信仰相符合，而聖多瑪斯更製造了完全的、完整的、邏輯的且一致的亞里士多德與基督教之綜合，二者均保證了亞里士多德之①尊位，將他的許多思想奉為神明，並在教堂中傳道之。” 在整整四個世紀中，亞里士多德的哲學與科學學說實際上以無人挑戰的勢力稱雄西方。
13世紀之後，亞里士多德的學說不再代表最令人信服的哲學與科學，他被視為科學的保守主義者。文藝復興興起後，柏拉圖學說走紅，亞里士多德的思想受到攻擊。科學界新的代表人物培根、伽利略、波義耳等人的科學成就都批判到亞里士多德的思想，儘管他們不是直接針對亞里士多德本人，而是批駁當代亞里士多德學說的宣傳者，但兩者分不開。在哲學上的命運也一樣，
17世紀英國大哲學家霍布斯在其重要著作《利維坦》中說：「我相信，沒有任何一件事比將亞里士多德的形而上學放在自然哲學中更荒謬的了。
沒有比他在政治學中提到的政體更令人反對的，也沒有比他的倫理學更無知的了。」
奉為神明不對；一概否定，也是錯誤的。亞里士多德當然不是完全正確，他的許多結論被新的科學所代替或被推翻，但他探索自然的方法和角度，他所提出的問題則仍然是有價值的。敘述亞里士多德對後世的影響，本身就是在研究西方思想史。其中有一部分是簡單的、直接的：他的學說給人們提供了知識，研究和學習他的著作的人比比皆是，不少哲學家、思想家、詩人、劇作家，在其作品中有亞里士多德思想的影子。
還有一種影響是細微的、悄悄的：亞里士多德的思想結構和內容的烙印深深打在後代人身上。亞里士多德的概念和術語有相當一部分一直在哲學和科學中沿用，就是反對他的人也在用他的語言或語言方式反對他。
當我們今天談論形式與質料、種與屬、能量與潛能、本體與性質、偶然與本質時，我們就是在不知不覺地使用亞里士多德的語言並且用兩千年前在希臘已經鍛造好了的概念和術語思考問題。
亞里士多德的自然科學著作的大部分結論的確已經過時，它們只有科學史的價值了，但其哲學思想絶不像霍布斯說的那樣毫無意義，相反，倒是黑格爾的斷語正確：「假使一個人真想從事哲學工作，那就沒有什①麼比講述亞里士多德這件事更值得去做了。」 《形而上學》《倫理學》等著作，雖然不是完美之作，但它們仍不失為是經典文獻，是任何涉及相關問題的人不可不讀的。所以在這方面，亞里士多德尚未落伍。書中的一些觀點對當代爭論問題仍有啟迪，現代哲學家甚至還把他當作一個傑出的同事，不時請教。
