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宇宙論方面。墨子認為，宇宙是一個連續的整體，個體或局部都是由這個統一的整體分出來的，都是這個統一整體的組成部分。換句話說，也就是整體包含著個體，整體又是由個體所構成，整體與個體之間有著必然的有機聯系。從這一連續的宇宙觀出發，墨子進而建立了關於時空的理論。他把時間定名為「久」，把空間定名為「宇」，並給出了「久」和 「宇」的定義，即「久」為包括古今旦暮的一切時間，「宇」為包括東西中南北的一切空間，時間和空間都是連續不間斷的。
在時空理論的基礎上，墨子建立了自己的運動論。他把時間、空間和物體運動統一起來，聯系在一起。他認為，在連續的統一的宇宙中，物體的運動表現為在時間中的先後差異和在空間中的位置遷移。沒有時間先後和位置遠近的變化，也就無所謂運動，離開時空的單純運動是不存在的。
對於物質的本原和屬性問題，墨子指出，「無」有二種，一種是過去有過而現在沒有了，如某種滅絕的飛禽，這不能因其已不存在而否定其曾為「有」；一種是過去就從來沒有過的事物，如天塌陷的事，這是本來就不存在的「無」。本來就不存在的「無」不會生「有」，本來存在後來不存在的更不是「有」生於「無」。
數學方面墨子是中國歷史上第一個從理性高度對待數學問題的科學家，他給出了一系列數學概念的命題和定義，這些命題和定義都具有高度的抽象性和嚴密性。
