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朱亮祖等亦自平樂來會，攻城益急，也兒吉尼倉皇出走，追執之。廖永忠等兵次南寧，元千戶宋真執其守將平章咬住等以降，廣西悉平。徐達等出師北伐，既平山東、河南，率師至通州，元主北遁。元都既平，徐達、常遇春等進取山西路，適湯和、楊璟等南征還，上命湯和楊璟俱為偏將軍，引兵助徐達等進取山西，又調副將軍馮勝帥師由河南進征山西，所過郡縣多降。
時擴廓帖木兒以元主命，率師出太原取道保安徑，由居庸關進攻北平。徐達等乘虛進兵，直取太原。擴廓帖木兒聞之，還兵來救，其鋒甚鋭。傅友德、薛顯率敢死士擊卻之。敵軍營于城西，廓英、常遇春請夜卻之，會擴廓將豁鼻馬潛，使人約降，請為內應。達大喜，遂與訂期，乘夜襲之，內外夾攻，敵兵大亂。擴廓帖木兒聞變倉卒，跣一足急逾帳後，從十八騎遁去，遂克太原。其猗氏平陽等處皆降。徐達克河中府，遂會諸將取陝西，造浮橋，攻西安府。元平章王武率官屬軍民降。達遂遣馮勝，進取鳳翔，李思齊率所部奔臨洮。徐達進兵隴州、秦州及鞏昌，乃遣馮勝統兵進逼臨洮。李思齊窮迫，遂舉城降。大軍圍慶陽，王保保率兵來援，為明師所扼，不得至，慶陽城破，張良臣投井中，引出斬之。慶陽平，並下平涼，王保保賀宗哲皆北遁，陝西悉平。徐達等班師還京師。
上封子九人為王，大封功臣，為公侯伯有差，死者肖像祀之。置六部官，以分理庶務。放元宮人，旁求隱逸及孝弟力田、賢良方正文學之士。建大本堂，命取古今圖籍充其中，延儒臣教授太子諸王。以孔希學襲封衍聖公，孔希大為曲阜縣知縣。
親耕借田，免輸天下各處田租。未幾，又統免天下田租。命皇后親蠶。命翰林為文，無事浮藻。禁四六文辭。詔天下郡縣皆立學。群臣親老者許歸養。天下大定，惟偽夏主明升。尚據巴蜀。洪武四年正月，上命湯和為征西將軍，同楊璟、廖永忠、周德興、曹良臣等，率舟師自荊湘，由瞿塘趨重慶；傅友德為征虜將軍，同顧時、陳德、汪興祖等，率騎自陝西，由秦隴趨成都。太祖密渝友德曰：「蜀人聞吾西伐，必悉其精鋭東守瞿塘，北阻金牛，若出其不意，直搗階、文，門戶既隳，腹心自潰。」友德頓首受命。傅友德進兵，揚言出金牛直搗階、文。
連戰克階、文、綿、漢四州。廖永忠乃與湯和分道併進，約會重慶府。永忠師行，沿江州縣望風奔附，乘勝抵重慶。明升君臣大懼。其臣劉仁勸升奔成都。母彭氏曰：「事勢如此，縱往成都，不過延命旦夕，何益？不如降也。」升遂面縛銜璧奉表降。蜀地悉平。明升至京師，上封為歸義侯。遣使祭歷代帝王陵寢。置通政使，禁奏事，不許關白中書。縱苑中禽獸，惟以虎縛送光祿寺。禁僧道閒游，無度牒者，不許越境。每縣只許存寺觀一所，月具結，男女非年過四十者，不許為僧尼。定大明律法。
上欲相胡惟庸，劉基力言其不可，勿聽，竟相惟庸。惟庸讒劉基，上奪劉基祿，基遂留京師。胡惟庸欲謀亂，忌基，鴆殺之。十三年丞相胡惟庸謀逆，誑言所居井湧灃泉，邀上往觀。
乘輿將出，內侍雲奇知其謀，勒馬言狀，氣方勃舌，不能達意，上怒其不敬，左右撾捶亂下，奇垂斃，尚手指賊臣第，弗為痛縮。上方悟，登城眺察，見惟庸第內兵甲伏屏帷間數匝。上亟返。遣兵圍其第，罪人一一就縛，悉誅之。上召雲奇，死矣，深悼之，追封右少監，賜葬鐘山。胡惟庸辭連李善長，上赦之。
宋濂、孫宋慎，坐黨逆被刑，籍其家，械濂至京師。上怒，欲誅之。皇后諫曰：「宋濂親教太子、諸王書，豈若是恝？況濂致仕家居，必不知。」上乃使宋慎茂州安置，至夔州卒。胡惟庸死，上乃思劉基，以基孫封為誠意伯。
時天下已定，惟元梁王把匝刺瓦爾密據云南，殺信使。十四年九月，上命穎川侯傅友德為征南將軍，永昌侯蘭玉、西平侯沐英為副將軍，帥師三十萬，以征雲南，上餞于龍江，授以成算，旌旗蔽江而上。友德至湖廣，分遣都督郭英等帥兵五萬，由四川趨烏撒。友德等帥大兵，由辰沅趨貴州。友德等師至普安，元梁王把匝刺瓦爾密，遣平章達裡麻，將精兵十餘萬，屯曲靖，以拒明師。而兵方到，友德倍道疾趨，出其不意，徑至曲靖，忽大霧四塞，沖霧而行，阻水已臨白石江矣。頃之霧霽，達裡麻望見大驚。友德欲濟，沐英曰「不可。」乃整軍臨流欲濟，潛遣數十百人從下流渡，出其後，于山谷間鳴金鼓樹旗幟，為疑軍，達裡麻急撒眾禦之，沐英乃拔劍督師濟江。元陣動，明師奮擊，大破之，生擒達裡麻，遂平曲靖。友德分遣蘭玉、沐英帥師趨雲南，而自以眾數萬向烏撒，為郭英等聲援。把匝刺瓦爾密聞達裡麻敗，棄城走，驅妻子俱赴滇池而死。蘭玉、沐英等師至雲南，元右丞觀音保出降，雲南平。自出師至平雲南，僅百餘日。雲南平後，上召傅友德班師，沐英留鎮雲南。
沐英，定遠人，上初起兵時，養以為子，故命之留守。
