達爾文認為，使人承認許多類型之間有「種屬關係」的那些共同特徵，可以用起源的理論來加以更好的說明。接着，他在《概要》中談了一種類型同用起源理論能很好說明屬於比較解剖學和胚胎學事實的那些範疇相似或一致的情況。他舉了一個前肢構造的總平面圖的經典例子，指出許多還是歌德提出的關於位變異構體的分化的事實，把這些事實叫做歌德的術語——「形態學」。最後，某些胚胎的事實只能用繼承共同的祖先來說明。
而後，他又分析了這樣一個問題：為什麼年輕時期很少發生變異而更接近祖先，這是因為選擇往往是在比較晚的時期才進行的。
最後，他舉了「發育不全的
退化的」器官作為自然界這種不合理的特點明顯的例子，因為從創造物種的觀點無論如何也不能解釋這種不合理性。他還多次指出，這些器官很可能在祖先們那裡起過作用，很可能由於不使用而衰退了。
達爾文在結尾的一章裡首先試圖用具體例子表明進化論觀點比創造理論優越。他從這方面研究了地理分佈的事實，研究了對其他臨近類型的關係以及三個亞洲犀牛種在解剖學上的構造情況和胚胎的發展過程。
在解決犀牛共同起源的問題時，達爾文做出結論說，事實完全允許把所有關於大綱
我們現在稱這樣的綱為類型的類型看成為有着共同的起源的東西。
達爾文指出，新理論提高了對生物學的興趣，因為它提出了新的問題。他還強調指出，概括過程是很廣泛和宏偉的，根據這一概括，所有的生物都服從于一個統一的進化過程。
於是，我們看到：通過自然選擇的進化理論，達爾文不僅在
1842年已經建立，而且基本特點也完全提了出來。而如果要把《概要》各章中指出的打算將來充分加以描述的例子補充到上面，那麼可以感覺到，在當時，這個理論就是靠他所擁有的大量事實材料而建立起來的。但是，他當時還沒有同任何人談過自己「異端的」進化思想。他還要用大量的能證明這種進化思想的事實來充實自己複雜理論的每一個論點，這要徹底克服各種困難，而且只有那時才能把書公之於世。
而在科學界，他暫時還只能以一個卓越的博物學家的身份，主要是一個地質學家，珊瑚礁理論和許多地質學方面的論文、報告的作者的身份，一個很快獲得了廣泛聲譽的「比格爾」號博物學家的《考察日記》的作者的身份而為世人所知曉。
第九章 物種理論的概要
1定居唐恩在倫敦的生活，對於習慣在莊園或者城郊過自由自在生活的達爾文夫婦來說，已經不堪忍受了，特別是由於達爾文的健康狀況越來越壞。
他們已經生了兩個孩子，而埃瑪又懷上了第三個。他們決定從城市搬到農村，並且決定最多每兩三個星期到倫敦去一趟。
1842年
9月，達爾文夫婦買下了唐恩的莊園。這座莊園之所以吸引他們，是由於它是一個很偏僻而又舒適的地方，距倫敦不很遠。
唐恩村有幾百居民，位於兩條村道的交叉處，離莊園有四分之一英里遠。最近的兩個火車站距離莊園有
10英里，而到車站去倒成了一件大事。充當馬車伕的老園丁只好經常小心翼翼地駕駛着馬車，一會兒往山上走，一會兒沿著彎曲的鄉間土路往下走。因此達爾文不得不放棄自己原先打算經常去倫敦的想法。
買來的莊園一片荒蕪，舊房屋的樣子並不吸引人。為了使房屋有一個比較舒適的樣子，達爾文最初幾年付出了很多勞動，把它粉刷了一遍，開闢了一個花園和一個菜園，圍上籬笆，在房屋的第三層修了一個陽台，上面覆蓋上一層匍匐植物。周圍有一些森林，把白堊的露頭和被小路截成兩半的深壑掩蓋起來，還有河谷中的耕地。
達爾文在唐恩這個地方度過了他整個的一生直到晚年。在這裡達爾文寫出了許多使他享有盛名，並使在人們對生物界以及人在生物界的地位的看法中，產生巨大變化的博物學方面第一流的著作，他因為長期患病，所以每天工作最多不過兩三個小時。這種平靜的生活，只是由於偶爾去親戚那裡作短暫的旅行，或到倫敦去，或到其他城市參加英國科學協會會議，或到水療機關參加水療「訓練班」而中斷。這種生活同那種要求有很大的活動性的消耗極大體力的環球旅行截然不同。
達爾文住到唐恩後，起初曾打算每個月訪問倫敦一二次，以便出席一些學術協會會議或者同朋友們見見面。但是，由於這些旅行而引起的激動不安和健康的惡化，迫使他越來越少地進行這種旅行，他妻子在唐恩安排的舒適和安逸生活，也促使他不願去旅行，寧願邀請親屬和朋友到唐恩來做客。
由於達爾文每天工作的時間不能多於
3小時，所以客人的來訪，很少改變他的正常日程。當時最常去的客人有胡克、賴爾和亨斯羅。
2胡 克胡克比達爾文小
8歲，他是植物學家、基由皇家植物園園長的兒子。
他頭腦十分敏鋭，具有高度的總結才能，是一位最不知疲累的科學工作者。他們第一次相見是在
1839年。
1843年作為博物學家去南極探險的胡克歸來不久，便收到了達爾文的一封信。達爾文在信中祝賀胡克「從那漫長而光榮的航行平安歸來」。
共同的工作和利益使達爾文和胡克的關係非常密切。在達爾文的健康狀況惡化後，胡克是唯一在唐恩一獃就是幾天，而有時一獃就是幾個星期的客人。他善於使達爾文感到毫無拘束。
