回戶數十萬眾，向來迷信宗教，因那布敦兄弟，的是摩訶末後裔，稱他為大小和卓木，和卓木三字，乃是回語，譯作漢文，便是聖裔的意義，至此得了聖裔的檄文，自然望風響應。只庫車城主鄂對，恐怕強弱不敵，率了黨羽，擬奔伊犁，途次與阿敏圖相遇，仍令迴轉庫車，同去招撫。不料霍集占聞鄂對出走，已遣部下阿布都馳到庫車，把鄂對親族一一殺死，登陴固守。鄂對聞報，大哭一場，嗣與阿敏圖商議，請亟歸伊犁，添兵復仇。阿敏圖道：「我是奉命招撫，今不見叛眾，便想回去，叫我如何對將軍？」鄂對再三諫阻，阿敏圖只是不從，也是一個不識時務。且令鄂對先回伊犁。他只帶了百餘騎，馳到庫車，阿布都誘他入城，一陣亂剁，憑你阿敏圖如何忠誠，也入閻羅寶殿去了。清廷因兆惠剿撫準部，尚未竣事，別命都統雅爾哈善為靖逆將軍，率兵征回。雅爾哈善自吐魯番進攻庫車，大小和卓木引軍數千，越大戈壁來援，與清兵戰了兩次，都被打得落花流水，大小和卓木，退入城中；清兵乘勢圍攻，城堅難拔，提督馬得勝，募敢死兵六百名，暗掘地道，晝夜不息，將及城中，守兵聞地下隱有響聲，料是穿穴，便循途按索，到了城腳邊，掘下一洞，適通地道守兵，把草塞住，用火燃着，煙焰衝入穴中，可憐六百個清兵，不能進，不能退，都被燒得烏焦巴弓。好象竹管裡煨泥鰍。雅爾哈善經此大創，不敢力攻，大小和卓木乘機遁還，阿布都也率眾逃去。

清兵只得了一個空城，乾隆帝聞知大怒，飭將雅爾哈善馬得勝等，盡行正法，仍命兆惠移師南征。兆惠檄調各路兵，尚未到齊，因朝旨催促，即率步騎四千餘先進，過了天山，收復沙雅爾阿克蘇烏什等城，住阿克蘇城數日。後兵未至，兆惠性急如火，留副將軍富德駐阿克蘇，等待後軍，他竟帶了二、三千人，冒險前行。途中偵知大和卓木那布敦，在葉爾羌，小和卓木霍集占在喀什噶爾，乃再分兵八百名，使副都統愛隆阿，遏住喀什噶爾援路，自率千餘騎，徑趨葉爾羌。葉爾羌城東有河，叫作葉爾羌河，亦稱黑水，兆惠兵少，不能進攻，便倚水立營。遙見葉爾羌城南駝馬往來，是個闊大的牧場，兆惠欲奪作軍用，徑命兵士渡河，河上本有木橋，清兵跨橋而過，橋未拆斷，誘敵可知。方過了四百騎，誰知橋下暗有伏兵，鐃鈎齊起，將木橋鈎斷，城中出回兵五千騎，前來邀擊。隔河清兵，不能相救，河西四百騎，哪裡當得住回兵？急忙棄了馬匹，鳧水逃回。貪小失大。回兵復搭好了橋，逾橋東來，後面又添了步兵萬人，張着兩翼，來圍清兵。兆惠左右衝突，馬中槍，再斃再易，總兵高天喜戰歿，參贊明瑞亦受傷，雖殺了番兵千名，究竟眾寡懸殊，支持不住，只得退入營中，趕緊築壘，準備固守。番兵亦築起長圍，四面攻打，槍炮如雨，幸虧清營靠着叢林，槍彈多飛入林中，清兵伐樹，得了鉛彈數萬枚，還擊回兵，又復掘井得水，掘窖得粟，賴以不困。

兆惠遣了五卒，分路赴阿克蘇告急，又檄愛隆阿還軍阿克蘇，催援軍同至。愛隆阿未到阿克蘇，富德已接警報，忙率軍三千，冒雪赴援，到了呼拉瑪，距葉爾羌尚三百餘里，忽遇喀什噶爾回兵，截住去路，轉戰四晝夜，回兵越來越多，將富德軍圍住，接連數日，杳無援兵，富德急得了不得，一日，天氣昏黑，入夜尤甚，回兵各燃着火把，輪流進撲，富德連忙抵禦，拚命鏖鬥，突聞一片喊聲，自東而至，回兵紛紛倒退。富德乘勢殺出，火光中來了一員清將，乃是愛隆阿，富德大喜，即與愛隆阿合兵。愛隆阿道：「巴裡坤參贊阿公，亦到。」富德忙拍馬去會阿大臣，這位阿大臣，名叫阿里袞，他奉了廷旨，領兵六百名，解馬二千匹，駝一千頭，至阿克蘇，適值愛隆阿去催援軍，遂合軍前來，解了富德的圍。回兵在夜間不辨多少，四散潰遁。富德愛隆阿，與阿里袞兩下相見，欣喜過望，也不及休息，同趨葉爾羌。兆惠日望援軍，遙聞炮聲大作，料知援軍已至，即勒兵突圍，內外夾攻，殺敵千餘，毀了敵壘，同還阿克蘇。