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說到底，山川風物無非是文人寄情於茲的對象，在遊記中很少佔有主體地位，而且有的過分注重文字功夫而進行了較多的文學加工，使其具體風貌與記中所寫出入很大，有的是幾年甚至十幾年後的追記，不但其線條模糊記憶失真，而且時過境遷，取捨剪裁未必得當。反過來看《徐霞客遊記》，則覺得要高妙得多。首先，他的遊歷和記述都力求全面。每到一地，總是力圖在宏觀上全面地把握該地的風物、人文景觀，而對一組風景的觀照也儘量從不同角度、不同時光中進行反覆辨析描繪，漏游之地，則千方百計創造條件補游，有時對一座山、一川水常常選擇不同季節作再游、三游……。遊歷中，他總是選擇險途隘道，發微啟幽，為追求一種真實全面的感受，力求「峰峰手摩足抉」，往往能出人意料地發現新的景觀。
其次，在全面把握的基礎上，追求奇、險、絶。他不聽信前人的論斷或方志的誤導，哪裡最險則偏向哪裡，越是人跡罕至之地越能激發他的興趣，由於主觀精神的追求，他的遊記很少有人云亦云的現象，筆下充滿對奇、險、絶景的描繪與記錄，他說：「余謂游不必騎、亦不必同，惟指示之功，勝於追逐。余之慾行者，正恐其同；其不欲同者，正慮其騎也」。這種不畏艱險，願為天下先而追求「指示之功」的精神，實在是旅行家之為旅行家的至高境界。其三，觀察細緻，記錄及時，描繪準確。徐霞客每日必記，雖然白天旅途勞頓，晚上仍必執燈作記，把當時的遊歷詳細記錄，更有甚者，他白天也邊走邊記，在崖畔岩邊，他依石為案，奮筆不止，最真實地記錄下當時的勝景與感受。確因風餐露宿而不能當時作記，則必在二、三天內補記。其記雖在旅途中，卻並不是對風景名勝的簡單羅列，對每個風景的位置、特點、各景點的分佈、地形變化、交通路線都有記錄，不但真實可靠直逼實際，而且文字優美引人入勝。其四，徐霞客非常關心旅遊資源的開發和保護，他不僅僅是一位旅遊家，而且還是一位建設家，故在他的遊記中多次提出了開發、修建、使用和保護旅遊資源的方案。他選景不囿于傳統，反對為湊足整數的所謂「十景」、「八景」的濫竽充數的作法，而是實事求是，如風景特好，也不厭其多。在開發利用方面，他反對湮滅歷史遺蹟的作法，認為智者應「追遠而創其祠」，愚者才「最新而掩其跡」。
新建房舍應不妨礙古蹟，風景區建設應借景而不應因此而掩景……一句話，風景區開發應首先保持其渾然天成的原始風貌，再行議論設計方便遊覽的方案。
特別值得一提的是，他非常關注風景區的環境保護問題，多次提出不能把風景區糟踏成牛宮馬棧，臭穢不堪，這實在值得當世人借鑒學習。
除以上獨特之處，《遊記》還有兩方面重要內容。其一是豐富的地學知識。由於他觀察的細緻和發微探幽的精神，使他的遊歷具有了科學考察的性質，記中可見他對地貌、岩溶、江河、水文、氣象等都作了詳盡的考備和記錄，其中以對岩溶及江河的考察最為詳盡和科學，以對氣象的關注而特異於其他遊記。舉他對岩溶的考察為例，他系統地考察了從湖南到滇東磅礴數千里的石灰岩溶蝕地貌，對其分佈狀況、形成原因、由於發育不同而出現的地區差異等，作了科學的說明。
他深入考察了
100多個岩洞，對每個岩洞的考察都力求全面準確。如他深入觀察和描述了桂林七星岩的大小、深淺、洞內的複雜結構以及洞的外部情況等，其描述記錄與近代科學技術實測的結果相當接近。他比歐洲最早描述和考察石灰岩地貌的愛士培爾早
158年，比歐洲最早對石灰岩地貌進行系統分類的羅曼要早
200多年。從這個角度說，《徐霞客遊記》的科學文獻價值也是不容低估的。其二是對社會歷史的廣泛描摩。
徐霞客在明亡前夕的社會大動盪的歲月，舉步遐征，廣泛接觸社會各階層，使他更多地瞭解了社會底層生活狀況，對人民的疾苦感同身受，在他描繪一幅風俗長卷的同時，也反映了人民生活的困苦掙扎。作為一個旅遊家，他雖不可能完全認清社會的本質，但作為一個有着博大同情心的社會觀察者，他所關心的問題自然地與普遍的百姓生活密切相關，所以他的遊記總是記錄下了各地農業、水利、手工業、商業貿易等多方面的實際情況，同時，由於他的旅跡遍涉于邊陲大山，故對生活于此的少數民族的衣食住行、風俗習慣、民族語言等等都有記述。他也非常注重我國宗教的發展，而且並不孤立地看待宗教，特別是在記述不少人遁入空門的原因時，更聯繫了廣闊的社會背景。
一方面他流露出對佛教的好感，一方面也毫不避諱地真實刻劃了那些身披袈裟、趨炎附勢、趁人之危的醜惡嘴臉，並由此展開對社會政治黑暗現實的描繪，使其《遊記》又具有了社會批判意義。
